More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1168 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  100 
 
 
335 aa  691    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  39.81 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 
308 aa  209  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
321 aa  209  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  36.39 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  42.49 
 
 
328 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  43.69 
 
 
319 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  35.78 
 
 
317 aa  192  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  40.31 
 
 
316 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  41.1 
 
 
310 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
308 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  41.06 
 
 
328 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
350 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  44.34 
 
 
309 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  34.43 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  33.75 
 
 
316 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  33.44 
 
 
316 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  33.44 
 
 
316 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  44.85 
 
 
311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  31.09 
 
 
302 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 
301 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  31.09 
 
 
302 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  36.77 
 
 
316 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  38.33 
 
 
303 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  30.55 
 
 
301 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28400  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.23 
 
 
375 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  36.6 
 
 
322 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0690  ABC transporter related  42.4 
 
 
319 aa  165  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  37.9 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  28.02 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 
312 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  34.52 
 
 
304 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  31.21 
 
 
316 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  32.29 
 
 
289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  31.49 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  35 
 
 
311 aa  162  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  33.65 
 
 
594 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  35.45 
 
 
325 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
344 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  34.29 
 
 
307 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  33.9 
 
 
317 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.5 
 
 
299 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  37.7 
 
 
320 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35.38 
 
 
315 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.5 
 
 
236 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  32.56 
 
 
295 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  33.23 
 
 
314 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  32.93 
 
 
344 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.27 
 
 
240 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  33.73 
 
 
371 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  35.77 
 
 
341 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  35.87 
 
 
323 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  37.3 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  36.17 
 
 
315 aa  156  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.33 
 
 
322 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  32.06 
 
 
316 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  32.19 
 
 
320 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 
307 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  32.19 
 
 
320 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf625  ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
353 aa  155  1e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  31.1 
 
 
316 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  35.46 
 
 
321 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3735  ABC transporter related protein  34.01 
 
 
279 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284021  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 
312 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  35.74 
 
 
317 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02620  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.78 
 
 
337 aa  153  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  35.32 
 
 
311 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  34.68 
 
 
244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  36.97 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  32.91 
 
 
310 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  33.12 
 
 
590 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  32.32 
 
 
331 aa  152  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  37.02 
 
 
305 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  36.89 
 
 
318 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  35.6 
 
 
346 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  29.78 
 
 
316 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  33.58 
 
 
293 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  28.53 
 
 
337 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
317 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  34.31 
 
 
308 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
309 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.62 
 
 
293 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  34.27 
 
 
360 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.78 
 
 
305 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
330 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  34.29 
 
 
241 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  32.15 
 
 
309 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  35.92 
 
 
304 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0552  ABC transporter related  41.09 
 
 
320 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.652365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  37.77 
 
 
311 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  37.33 
 
 
346 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  34.5 
 
 
244 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  38.43 
 
 
312 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  34.96 
 
 
243 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  36.79 
 
 
315 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  33.21 
 
 
355 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  35.92 
 
 
346 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>