More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1545 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  100 
 
 
305 aa  629  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  52.3 
 
 
305 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 
301 aa  310  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  50 
 
 
299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  61.21 
 
 
236 aa  305  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  49.5 
 
 
308 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  48.68 
 
 
298 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  46.86 
 
 
303 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  47.02 
 
 
308 aa  290  3e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  60.18 
 
 
235 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  46.25 
 
 
369 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  47.45 
 
 
325 aa  278  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  44.48 
 
 
315 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  41.27 
 
 
316 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.53 
 
 
317 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  41.88 
 
 
315 aa  242  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  40.86 
 
 
316 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  41.06 
 
 
310 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  41.06 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  42.43 
 
 
311 aa  237  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  39.43 
 
 
336 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  41.72 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.2 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
307 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  42.16 
 
 
319 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  40 
 
 
320 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  40 
 
 
320 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  39.74 
 
 
328 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  51.61 
 
 
240 aa  225  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  40.65 
 
 
331 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 
314 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  47.93 
 
 
341 aa  222  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  39.07 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  38.76 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  39.48 
 
 
344 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  48.39 
 
 
360 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  37.46 
 
 
311 aa  218  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  38.59 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  37.74 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  35.91 
 
 
331 aa  215  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  37.42 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  37.5 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
261 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
317 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 
308 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  36.63 
 
 
309 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.75 
 
 
306 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  34.33 
 
 
308 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
309 aa  206  5e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  34.97 
 
 
308 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.51 
 
 
314 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  35.91 
 
 
325 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  35.43 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  36.91 
 
 
310 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  41.2 
 
 
247 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.3 
 
 
306 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  40.99 
 
 
328 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  41.71 
 
 
289 aa  189  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 
308 aa  188  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.54 
 
 
301 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.55 
 
 
309 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.04 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.64 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
310 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.54 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  30.39 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 
327 aa  182  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  33.89 
 
 
310 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  34.97 
 
 
304 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  40.18 
 
 
295 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  34.1 
 
 
308 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  38.74 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  33.66 
 
 
303 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  42.25 
 
 
245 aa  179  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  33.87 
 
 
338 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  33.45 
 
 
309 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
310 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.46 
 
 
312 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  40.91 
 
 
244 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  36.3 
 
 
293 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.97 
 
 
293 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  39.06 
 
 
315 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
310 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.54 
 
 
309 aa  177  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.95 
 
 
316 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  40.91 
 
 
244 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 
327 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  38.71 
 
 
309 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  33.77 
 
 
319 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  34.65 
 
 
308 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  34.11 
 
 
334 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  35.08 
 
 
298 aa  175  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  32.65 
 
 
298 aa  175  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.13 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  33.22 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.23 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>