More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3642 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  100 
 
 
310 aa  617  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  83.01 
 
 
310 aa  517  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  63.61 
 
 
310 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  62.83 
 
 
303 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  61.92 
 
 
305 aa  361  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  61.31 
 
 
309 aa  354  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  57.95 
 
 
304 aa  352  5e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  58.15 
 
 
334 aa  328  7e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  54.79 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  52.81 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0074  ABC transporter related protein  52.58 
 
 
309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  54.3 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
323 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  52.75 
 
 
316 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  51.8 
 
 
310 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
308 aa  295  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  50.33 
 
 
305 aa  291  7e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
373 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  46.03 
 
 
309 aa  279  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  50 
 
 
346 aa  278  6e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3716  ABC transporter related protein  52.58 
 
 
311 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  50.5 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  60.65 
 
 
249 aa  265  8e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  46.23 
 
 
316 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  39.49 
 
 
356 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.5 
 
 
303 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.67 
 
 
312 aa  199  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  36.6 
 
 
300 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  36.71 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  39.49 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  35.39 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  36.45 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  35.31 
 
 
327 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  46.4 
 
 
250 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.48 
 
 
293 aa  192  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  41.18 
 
 
316 aa  192  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.43 
 
 
309 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  41.16 
 
 
304 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.46 
 
 
369 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  39.26 
 
 
304 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
311 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  43.97 
 
 
315 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.43 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.58 
 
 
309 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  44.25 
 
 
327 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.66 
 
 
318 aa  189  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.16 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.46 
 
 
303 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  40.13 
 
 
307 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.09 
 
 
304 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  42.99 
 
 
287 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
390 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  41.34 
 
 
316 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  37.21 
 
 
298 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38.08 
 
 
307 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.76 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.45 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.51 
 
 
315 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  39.67 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  35.08 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  35.79 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  37.09 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.4 
 
 
337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.42 
 
 
305 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.27 
 
 
360 aa  182  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.39 
 
 
411 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  36.27 
 
 
312 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.62 
 
 
317 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.06 
 
 
297 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  40 
 
 
288 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 
259 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.59 
 
 
338 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  37.33 
 
 
301 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.29 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  40 
 
 
246 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
371 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  36.09 
 
 
313 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
309 aa  178  8e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  37.42 
 
 
304 aa  178  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  30.49 
 
 
312 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
311 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.81 
 
 
301 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 
312 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 
312 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 
312 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  36.42 
 
 
300 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  35.29 
 
 
305 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 
312 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  31.73 
 
 
319 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 
312 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 
312 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
305 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.14 
 
 
325 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
313 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 
309 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  37.14 
 
 
288 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.51 
 
 
312 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 
310 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>