More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2706 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  100 
 
 		 369 aa  741    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  65.59 
 
 		 315 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  58.52 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  57.23 
 
 		 325 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  54.98 
 
 		 310 aa  345  6e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  47.81 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  47.81 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  47.02 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  45.45 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  45.66 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  43.3 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  41.5 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  44.37 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  45.66 
 
 		 328 aa  287  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  47.1 
 
 		 305 aa  279  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  47 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  43.12 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  40.3 
 
 		 341 aa  269  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  47.1 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  54.11 
 
 		 236 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.16 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 314 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  43.69 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  41.29 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  42.36 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 322 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  43.83 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  44.19 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  40.78 
 
 		 306 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  42.31 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  42.07 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  41.53 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.58 
 
 		 307 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  40.26 
 
 		 309 aa  238  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  50.66 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  43.48 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  38.87 
 
 		 323 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  39.55 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  36.62 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  46.25 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  36.57 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  51.43 
 
 		 235 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.7 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  48.57 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.14 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  40.7 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  41.02 
 
 		 305 aa  209  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  47.85 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  46.33 
 
 		 289 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  38.57 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.86 
 
 		 303 aa  202  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.76 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  32.69 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  35.37 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.69 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  43.13 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.99 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 316 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  41.43 
 
 		 304 aa  195  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.5 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  31.96 
 
 		 321 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 		 327 aa  193  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  33.65 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  34.52 
 
 		 318 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  41.98 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  40.64 
 
 		 259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  40.72 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  34.42 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  42.15 
 
 		 314 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  38.12 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  33.43 
 
 		 338 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.89 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  38.12 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.91 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  33.91 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  34.42 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.39 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  36.44 
 
 		 244 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  34.08 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  35.48 
 
 		 314 aa  186  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>