More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4183 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  60.81 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  61.43 
 
 
323 aa  272  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  55.86 
 
 
307 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 
307 aa  264  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 
307 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  55.26 
 
 
308 aa  259  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  55.41 
 
 
306 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  56.44 
 
 
306 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  52.32 
 
 
236 aa  254  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  49.58 
 
 
235 aa  241  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  52.63 
 
 
325 aa  241  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  51.88 
 
 
245 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  52.51 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 
308 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  50.45 
 
 
317 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
369 aa  238  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  52.7 
 
 
310 aa  238  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  52.7 
 
 
319 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  49.1 
 
 
308 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  52.7 
 
 
320 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  52.7 
 
 
320 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  50.68 
 
 
315 aa  234  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 
316 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  50.9 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  53.15 
 
 
360 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  53.55 
 
 
344 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  51.08 
 
 
331 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  51.27 
 
 
261 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  49.56 
 
 
339 aa  229  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  51.34 
 
 
305 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.35 
 
 
301 aa  228  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  50.45 
 
 
298 aa  228  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  49.32 
 
 
311 aa  226  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  50 
 
 
328 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  49.09 
 
 
336 aa  225  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  51.61 
 
 
305 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 
311 aa  223  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  49.78 
 
 
316 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  44.21 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 
314 aa  215  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  50 
 
 
329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  46.82 
 
 
317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  48.02 
 
 
310 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  46.58 
 
 
331 aa  212  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  48.65 
 
 
317 aa  210  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
309 aa  201  9e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  44.02 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  46.4 
 
 
341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  43.72 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  43.46 
 
 
309 aa  191  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  42.18 
 
 
325 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
253 aa  186  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
317 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  39.55 
 
 
292 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  39.55 
 
 
292 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 
252 aa  180  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  39.55 
 
 
292 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  41.91 
 
 
301 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  39.55 
 
 
292 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  37.92 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  37.5 
 
 
244 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
292 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  40.79 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  37.5 
 
 
244 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  37.5 
 
 
244 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  36.67 
 
 
244 aa  178  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  40 
 
 
308 aa  177  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  42.04 
 
 
307 aa  178  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  40.27 
 
 
578 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  39.55 
 
 
295 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  36.67 
 
 
244 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  41.78 
 
 
315 aa  175  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  42.79 
 
 
307 aa  174  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 
293 aa  174  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.55 
 
 
312 aa  174  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  36.67 
 
 
244 aa  174  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  36.25 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  37.08 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  41.4 
 
 
308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  38.16 
 
 
310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  37.95 
 
 
308 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  36.25 
 
 
244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  36.25 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  37.74 
 
 
319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.86 
 
 
316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  35.83 
 
 
244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  41.59 
 
 
293 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  40.47 
 
 
340 aa  171  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.44 
 
 
252 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  38.57 
 
 
289 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  38.99 
 
 
284 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  38.79 
 
 
255 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  35.83 
 
 
244 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  36.24 
 
 
306 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  39.01 
 
 
300 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2114  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 
261 aa  169  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>