More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0989 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  100 
 
 
331 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  48.81 
 
 
310 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  41.08 
 
 
325 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  40 
 
 
310 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  38.74 
 
 
314 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  42.09 
 
 
303 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  39.17 
 
 
315 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  39.74 
 
 
311 aa  239  5e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
322 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.62 
 
 
369 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  41.48 
 
 
360 aa  235  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  40.26 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  44.13 
 
 
329 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  40.26 
 
 
328 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  49.09 
 
 
236 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  44.23 
 
 
325 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  40.92 
 
 
305 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  38.02 
 
 
309 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  39.24 
 
 
331 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  41.4 
 
 
344 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  37.75 
 
 
308 aa  225  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  37.06 
 
 
317 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  39.56 
 
 
320 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
315 aa  224  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
308 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  39.56 
 
 
320 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  35.91 
 
 
305 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  41.53 
 
 
316 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  36.96 
 
 
299 aa  223  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.33 
 
 
301 aa  220  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  39.3 
 
 
311 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  35.64 
 
 
308 aa  219  6e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  37.17 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 
316 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
312 aa  215  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  46.58 
 
 
240 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  37.86 
 
 
341 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
307 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.6 
 
 
306 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  39.05 
 
 
317 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  36.51 
 
 
298 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  51.47 
 
 
247 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  37.99 
 
 
339 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
307 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  37.58 
 
 
307 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  37.46 
 
 
323 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  34.54 
 
 
308 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  36.39 
 
 
306 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.77 
 
 
316 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  44.4 
 
 
261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  39.41 
 
 
309 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  37.75 
 
 
313 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  41.44 
 
 
235 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.92 
 
 
337 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
309 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.28 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  35.08 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
318 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  36.45 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  39.6 
 
 
304 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 
245 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  33.78 
 
 
301 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  39.11 
 
 
340 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  43.27 
 
 
245 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  42.38 
 
 
341 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.73 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  34.43 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.83 
 
 
308 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  37.07 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  29.71 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  33.99 
 
 
311 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  37.04 
 
 
309 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  35.37 
 
 
303 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  33.44 
 
 
298 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  31.29 
 
 
324 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  37.07 
 
 
313 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  42.01 
 
 
304 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5657  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
258 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893177  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  37.6 
 
 
307 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  34.84 
 
 
305 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
313 aa  169  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
307 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  32.66 
 
 
314 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.89 
 
 
309 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
253 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30 
 
 
305 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.2 
 
 
279 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 
309 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  35.16 
 
 
360 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  39.82 
 
 
579 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 
309 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
309 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 
318 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>