More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2945 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  100 
 
 
314 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  66.23 
 
 
308 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  62.46 
 
 
309 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  55.99 
 
 
309 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  44.59 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  44.9 
 
 
310 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 
314 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  39.62 
 
 
317 aa  238  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.74 
 
 
331 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  46.25 
 
 
369 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  37.17 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  37.18 
 
 
336 aa  219  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
308 aa  215  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  35.12 
 
 
308 aa  215  8e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  36.72 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.76 
 
 
305 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  37.62 
 
 
315 aa  206  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.45 
 
 
315 aa  205  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.51 
 
 
305 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  36.96 
 
 
341 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  35.81 
 
 
311 aa  202  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.63 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  37.9 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  44.5 
 
 
319 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  36.59 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  36.18 
 
 
307 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.41 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  43.72 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  45.21 
 
 
247 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  36.22 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  36.22 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 
308 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  36.04 
 
 
339 aa  195  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  36.04 
 
 
308 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.15 
 
 
303 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  35.33 
 
 
299 aa  193  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  35.41 
 
 
307 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  34.52 
 
 
328 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 
307 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  35.53 
 
 
306 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.77 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  42.86 
 
 
236 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 
312 aa  188  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  41.9 
 
 
316 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  39.35 
 
 
261 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  34.19 
 
 
331 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  36.67 
 
 
298 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  40.09 
 
 
360 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  33.89 
 
 
325 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  40.27 
 
 
235 aa  185  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  33.75 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  34.19 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  33.12 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  38.07 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  42.36 
 
 
290 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  30.79 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  36.94 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  31.96 
 
 
313 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  36.05 
 
 
296 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  31.73 
 
 
337 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  35.95 
 
 
289 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  31.09 
 
 
316 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  31.13 
 
 
309 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  37.07 
 
 
245 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  28.94 
 
 
319 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  31.53 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.65 
 
 
253 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  39.15 
 
 
251 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  37 
 
 
311 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  35.42 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  33.19 
 
 
301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  36.14 
 
 
286 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  30.38 
 
 
316 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 
313 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.16 
 
 
312 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  27.71 
 
 
311 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  39.07 
 
 
303 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  29.15 
 
 
316 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  36.79 
 
 
295 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 
331 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  28.34 
 
 
310 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  38.6 
 
 
303 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  32.72 
 
 
291 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  38.6 
 
 
303 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  29.43 
 
 
321 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  35.75 
 
 
341 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 
312 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  38.6 
 
 
303 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.6 
 
 
331 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  38.6 
 
 
331 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  34.12 
 
 
293 aa  148  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  29.02 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  38.68 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  39.17 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>