More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0068 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  100 
 
 
329 aa  654    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  58.39 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  56.41 
 
 
320 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  56.41 
 
 
320 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  55.52 
 
 
319 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  55.34 
 
 
328 aa  342  5.999999999999999e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  53.77 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  55.77 
 
 
331 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  42.86 
 
 
325 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  43.12 
 
 
369 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
308 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  45.91 
 
 
316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  40.65 
 
 
315 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.07 
 
 
317 aa  249  6e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  40.97 
 
 
310 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  44.84 
 
 
310 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  40.33 
 
 
308 aa  237  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  41.78 
 
 
306 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  43.51 
 
 
341 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 
317 aa  235  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  40.71 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  41.03 
 
 
316 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  43.79 
 
 
339 aa  232  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
315 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
336 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  43.41 
 
 
311 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  43.95 
 
 
331 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
314 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
307 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  40.33 
 
 
307 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
307 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.14 
 
 
298 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 
308 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  47.3 
 
 
236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
312 aa  222  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  38.76 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  43.32 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.69 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  37.5 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  40.52 
 
 
305 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  39.87 
 
 
303 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.51 
 
 
306 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.94 
 
 
301 aa  216  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  50 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
261 aa  212  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
317 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  47 
 
 
235 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  38.69 
 
 
322 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  36.54 
 
 
323 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.24 
 
 
309 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  36.07 
 
 
308 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  47.85 
 
 
247 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  35.31 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  35.41 
 
 
309 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.95 
 
 
316 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  34.49 
 
 
327 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.16 
 
 
309 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.12 
 
 
321 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  45.5 
 
 
245 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  37.18 
 
 
300 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  36.01 
 
 
298 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  36.22 
 
 
341 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.41 
 
 
308 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.39 
 
 
337 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  35.8 
 
 
338 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.71 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  34.19 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  36.48 
 
 
303 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  35.28 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  35.35 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  38.82 
 
 
334 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  44.1 
 
 
250 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
302 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  38.94 
 
 
307 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.93 
 
 
301 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  35.18 
 
 
303 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  42.8 
 
 
332 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  32.79 
 
 
313 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  37.66 
 
 
316 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
318 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  32.59 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 
313 aa  179  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 
331 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.85 
 
 
331 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.85 
 
 
303 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  34.85 
 
 
331 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.81 
 
 
300 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  33.54 
 
 
328 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
318 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  37.13 
 
 
311 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  34.19 
 
 
309 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  44.04 
 
 
279 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  32.8 
 
 
310 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  32.92 
 
 
328 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  33.22 
 
 
313 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
302 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  34.5 
 
 
298 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  36.39 
 
 
301 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>