More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2202 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  100 
 
 
261 aa  538  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  50.21 
 
 
236 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 
312 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  50.43 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
315 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  50 
 
 
306 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  48.72 
 
 
235 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  51.27 
 
 
240 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  48.52 
 
 
323 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  52.29 
 
 
308 aa  227  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  52.29 
 
 
360 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  49.52 
 
 
325 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  45.15 
 
 
308 aa  224  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  48.23 
 
 
319 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 
307 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  51.43 
 
 
320 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  49.34 
 
 
316 aa  222  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  51.43 
 
 
320 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  49.57 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  51.9 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  48.86 
 
 
298 aa  218  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  51.43 
 
 
328 aa  218  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  48.28 
 
 
303 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
307 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 
316 aa  216  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  48.87 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  47.26 
 
 
344 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  48.57 
 
 
369 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  47.26 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  48.85 
 
 
305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  45.16 
 
 
329 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.68 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  46.05 
 
 
305 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  47 
 
 
299 aa  209  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
336 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  46.67 
 
 
317 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  46.29 
 
 
339 aa  205  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  48.33 
 
 
315 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  49.1 
 
 
322 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  46.81 
 
 
245 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  45.8 
 
 
247 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  46.67 
 
 
310 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  45.41 
 
 
308 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  44.1 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 
308 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  44.4 
 
 
331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
311 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2114  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
261 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  45.21 
 
 
341 aa  192  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
317 aa  192  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  42.2 
 
 
317 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  39.35 
 
 
314 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  41.18 
 
 
309 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
309 aa  185  7e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  43.61 
 
 
253 aa  178  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  43.56 
 
 
279 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  42.06 
 
 
332 aa  175  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
317 aa  175  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  43.7 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  38.43 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  37.9 
 
 
308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  42.86 
 
 
298 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  42.92 
 
 
338 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  41.7 
 
 
325 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
261 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
341 aa  168  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  43.72 
 
 
252 aa  168  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  41.55 
 
 
305 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  37.61 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  42.4 
 
 
306 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  38.57 
 
 
328 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.81 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  41.48 
 
 
302 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 
303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  34.32 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  37.99 
 
 
300 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  43.05 
 
 
259 aa  162  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
305 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
303 aa  161  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  39.17 
 
 
309 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  33.47 
 
 
306 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  40.18 
 
 
334 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  39.27 
 
 
293 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  38.33 
 
 
512 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  37.39 
 
 
250 aa  159  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
301 aa  159  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 
241 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 
308 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5657  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
258 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893177  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  36.13 
 
 
241 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.22 
 
 
328 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  42.99 
 
 
288 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 
295 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3616  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
234 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3903  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
234 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3812  putative bacteriocin ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
234 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 
244 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>