More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4701 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  100 
 
 
311 aa  614  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.4 
 
 
312 aa  311  7.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  45.62 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  46.3 
 
 
310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
312 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  45.69 
 
 
311 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
312 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
312 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  42.12 
 
 
312 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
312 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
312 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 
312 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.18 
 
 
312 aa  262  6e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  38.26 
 
 
321 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  43.37 
 
 
311 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  42.26 
 
 
337 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  43.23 
 
 
315 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.02 
 
 
316 aa  228  9e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 
334 aa  227  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 
324 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.61 
 
 
330 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  39.29 
 
 
327 aa  223  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.26 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  38.19 
 
 
310 aa  219  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 
328 aa  218  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 
328 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 
308 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  46.58 
 
 
257 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.07 
 
 
325 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  40.69 
 
 
320 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.54 
 
 
328 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  43.86 
 
 
250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  37.62 
 
 
311 aa  215  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  36.89 
 
 
313 aa  215  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  42.05 
 
 
293 aa  215  9e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.59 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.16 
 
 
333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  36.89 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  38.96 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  37.62 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.21 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  38.54 
 
 
305 aa  211  9e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.02 
 
 
338 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  40.25 
 
 
320 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.26 
 
 
327 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.81 
 
 
319 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 
325 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  39.94 
 
 
320 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 
310 aa  209  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  39.2 
 
 
314 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
345 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  39.75 
 
 
327 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  45.09 
 
 
245 aa  208  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.11 
 
 
321 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 
325 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  36.36 
 
 
335 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  40.63 
 
 
321 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  34.3 
 
 
287 aa  207  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  40.26 
 
 
304 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.75 
 
 
317 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 
322 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.92 
 
 
323 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.99 
 
 
308 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.67 
 
 
316 aa  205  7e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  39.48 
 
 
310 aa  205  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.56 
 
 
318 aa  205  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.33 
 
 
326 aa  205  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 
333 aa  204  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  39.68 
 
 
306 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  39.48 
 
 
373 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.39 
 
 
317 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 
446 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.01 
 
 
343 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  40.45 
 
 
304 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.37 
 
 
331 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  39.16 
 
 
304 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  40.13 
 
 
325 aa  203  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 
308 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.54 
 
 
323 aa  203  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.19 
 
 
329 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  39.94 
 
 
313 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  44 
 
 
240 aa  203  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 
326 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  39.35 
 
 
303 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.88 
 
 
309 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  38.83 
 
 
304 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  38.83 
 
 
326 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37.42 
 
 
326 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  40.45 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  38.83 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>