More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1974 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 		 321 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  89.1 
 
 		 320 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  89.1 
 
 		 320 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  74.68 
 
 		 303 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  74.33 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  72.82 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  72.27 
 
 		 325 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  69.26 
 
 		 304 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  69.26 
 
 		 304 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  68.93 
 
 		 304 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  69.18 
 
 		 320 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  68.28 
 
 		 373 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  68.61 
 
 		 304 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  68.61 
 
 		 326 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  69.58 
 
 		 304 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  69.58 
 
 		 306 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  69.58 
 
 		 351 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  69.58 
 
 		 304 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  68.93 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  69.58 
 
 		 304 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  69.58 
 
 		 304 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  69.58 
 
 		 351 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  72.46 
 
 		 304 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  64.92 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  61.46 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  61.98 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  61.74 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  62.21 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  61.04 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  61.06 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  57.42 
 
 		 307 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  54.89 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  58.96 
 
 		 301 aa  346  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  54.75 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  57.01 
 
 		 323 aa  342  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  55.81 
 
 		 327 aa  341  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  56.31 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  57.23 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  53.07 
 
 		 315 aa  334  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  55.02 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  55.31 
 
 		 311 aa  319  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  57.1 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  52.27 
 
 		 309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  51.62 
 
 		 309 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  51.62 
 
 		 309 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  49.67 
 
 		 302 aa  296  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  45.28 
 
 		 305 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  48.05 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  46.41 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 312 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 		 293 aa  275  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  48.22 
 
 		 306 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  48.11 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  47.08 
 
 		 339 aa  272  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  47.8 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  44.98 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  47.3 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  46.3 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  45.02 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.75 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  45.63 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  44.69 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  44.21 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  44.37 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  41.94 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  40.52 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  42.76 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.53 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  38.19 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.23 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  39.55 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.03 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  41.04 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.81 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  40.65 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.05 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.76 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.06 
 
 		 320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.12 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.19 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 322 aa  209  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.5 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  40.39 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.23 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.14 
 
 		 312 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.39 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  40.07 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  37.94 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  37.94 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.66 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>