More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3378 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  100 
 
 
320 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 
315 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 
312 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 
312 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 
312 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  36.08 
 
 
312 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
312 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  40.62 
 
 
311 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
311 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  37.69 
 
 
320 aa  225  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
311 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.37 
 
 
312 aa  222  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  41.69 
 
 
321 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  49.33 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  40.44 
 
 
320 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.12 
 
 
319 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.76 
 
 
310 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.74 
 
 
316 aa  209  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  48.67 
 
 
313 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.99 
 
 
332 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  37.19 
 
 
311 aa  206  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  31.87 
 
 
321 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  44.84 
 
 
251 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.99 
 
 
310 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.8 
 
 
312 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  39.5 
 
 
320 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  44.3 
 
 
250 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  37.38 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  39.62 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  39.62 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
323 aa  198  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.78 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  34.78 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.84 
 
 
330 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.09 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  38.8 
 
 
310 aa  195  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
301 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  40 
 
 
301 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.11 
 
 
339 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.28 
 
 
324 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 
324 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
335 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  43.84 
 
 
245 aa  193  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  41.89 
 
 
284 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  36.88 
 
 
314 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  40.19 
 
 
317 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.49 
 
 
309 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0537  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 
321 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  41.15 
 
 
257 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  32.81 
 
 
310 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 
323 aa  192  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  45.37 
 
 
340 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  45.45 
 
 
306 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  44 
 
 
245 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  35.51 
 
 
339 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 
308 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.98 
 
 
324 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.22 
 
 
335 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.18 
 
 
321 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  36.71 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  34.87 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.31 
 
 
312 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.99 
 
 
325 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  36.45 
 
 
304 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  36.45 
 
 
304 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
330 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.45 
 
 
366 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 
366 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 
366 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.49 
 
 
304 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  42.04 
 
 
326 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 
348 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
322 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  41.7 
 
 
309 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.38 
 
 
314 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  35.29 
 
 
339 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.37 
 
 
279 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  35.29 
 
 
339 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  36.14 
 
 
304 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  38.61 
 
 
304 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  36.04 
 
 
341 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 
305 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.34 
 
 
323 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.73 
 
 
334 aa  186  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.02 
 
 
347 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 
339 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
287 aa  186  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  37.34 
 
 
326 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.38 
 
 
325 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  37.34 
 
 
304 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>