More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10710 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
316 aa  642    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  66.02 
 
 
311 aa  427  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  65.48 
 
 
327 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  63.75 
 
 
310 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  55.41 
 
 
313 aa  355  5e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  54.37 
 
 
310 aa  353  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
312 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
312 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  45.45 
 
 
312 aa  275  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
312 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
312 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
312 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  44.63 
 
 
311 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 
310 aa  245  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  42.02 
 
 
311 aa  228  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  36.98 
 
 
321 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  48.46 
 
 
257 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 
327 aa  225  8e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.53 
 
 
312 aa  219  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
339 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.16 
 
 
312 aa  216  5e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  37.34 
 
 
320 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  37.54 
 
 
311 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 
323 aa  209  7e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 
328 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  38.2 
 
 
315 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
301 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 
328 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  36.59 
 
 
339 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  37.22 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  37.22 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  36.79 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.69 
 
 
326 aa  199  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 
332 aa  199  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.54 
 
 
329 aa  198  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.62 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  37.54 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.98 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.99 
 
 
328 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
325 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  36.86 
 
 
319 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  36.28 
 
 
339 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  40.48 
 
 
309 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  37.62 
 
 
304 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  34.59 
 
 
337 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  34.59 
 
 
337 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  36.01 
 
 
337 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 
321 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  36.91 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  36.16 
 
 
339 aa  189  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  37.62 
 
 
340 aa  189  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.06 
 
 
310 aa  189  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 
345 aa  188  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  36.71 
 
 
302 aa  188  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.94 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  36.79 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  32.7 
 
 
310 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  36.96 
 
 
305 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.6 
 
 
334 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  37.62 
 
 
300 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  41.26 
 
 
251 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.98 
 
 
279 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.66 
 
 
322 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.94 
 
 
338 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  39.1 
 
 
311 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.96 
 
 
323 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 
308 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
287 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.94 
 
 
308 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 
360 aa  186  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.84 
 
 
316 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  34.3 
 
 
315 aa  186  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.29 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  36.16 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.94 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  36.71 
 
 
321 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  36.31 
 
 
320 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  37.62 
 
 
313 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.65 
 
 
324 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  35.65 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.98 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  35.5 
 
 
344 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  36.07 
 
 
304 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  36.07 
 
 
304 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  36.07 
 
 
304 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  36.07 
 
 
306 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.71 
 
 
334 aa  182  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.6 
 
 
319 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  33.98 
 
 
316 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  40.76 
 
 
304 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  40.76 
 
 
351 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>