More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_461 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 
316 aa  651    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  96.19 
 
 
316 aa  624  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  91.77 
 
 
316 aa  609  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.39 
 
 
339 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.37 
 
 
322 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.04 
 
 
328 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
308 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 
308 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.35 
 
 
330 aa  242  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.77 
 
 
334 aa  241  7.999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 
329 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.21 
 
 
308 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.45 
 
 
328 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 
324 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.53 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.56 
 
 
308 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.07 
 
 
325 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.45 
 
 
321 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  40.97 
 
 
327 aa  237  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.33 
 
 
308 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.21 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.45 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.99 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
308 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 
324 aa  232  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 
323 aa  232  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.72 
 
 
279 aa  231  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.42 
 
 
327 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.39 
 
 
325 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  40.14 
 
 
330 aa  229  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 
330 aa  228  7e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.32 
 
 
333 aa  227  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 
241 aa  226  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.21 
 
 
323 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 
324 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 
327 aa  225  7e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 
324 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.51 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  38.8 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.98 
 
 
326 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 
338 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.87 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.61 
 
 
325 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.87 
 
 
446 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 
316 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.45 
 
 
329 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.48 
 
 
345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.83 
 
 
331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 
449 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
255 aa  215  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.69 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  37.46 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.9 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 
332 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  39.29 
 
 
311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.66 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.03 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.92 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  37.78 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.46 
 
 
359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.5 
 
 
319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  39.67 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.18 
 
 
371 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.59 
 
 
321 aa  211  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  37.06 
 
 
324 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.72 
 
 
282 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.07 
 
 
347 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6251  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.03 
 
 
353 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382006  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 
348 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.34 
 
 
331 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 
323 aa  209  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.06 
 
 
320 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 
310 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  37.13 
 
 
312 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.33 
 
 
330 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
312 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.17 
 
 
309 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 
326 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.81 
 
 
345 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  38.68 
 
 
319 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
312 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
312 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
312 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
312 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
343 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
312 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 
338 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
312 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 
345 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
312 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 
353 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  39.35 
 
 
300 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2055  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 
318 aa  206  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.280833  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.83 
 
 
316 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.39 
 
 
309 aa  206  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  36.42 
 
 
314 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.54 
 
 
351 aa  205  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>