More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5104 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 
324 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  69.57 
 
 
325 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  65.3 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  62.93 
 
 
325 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  59.21 
 
 
325 aa  351  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  59.22 
 
 
321 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  55.95 
 
 
324 aa  339  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.45 
 
 
328 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  53.77 
 
 
326 aa  322  7e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  54.7 
 
 
334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  49.68 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.32 
 
 
329 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.87 
 
 
328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.23 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  46.34 
 
 
330 aa  300  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  46.35 
 
 
327 aa  298  9e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.12 
 
 
334 aa  293  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  49.07 
 
 
325 aa  288  8e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.37 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.26 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 
334 aa  281  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 
330 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.2 
 
 
322 aa  279  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.69 
 
 
327 aa  279  6e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.83 
 
 
323 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  49.02 
 
 
327 aa  275  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.94 
 
 
324 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.03 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.09 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.49 
 
 
316 aa  272  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.72 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.72 
 
 
323 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.28 
 
 
320 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.77 
 
 
321 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
317 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
326 aa  256  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  45.86 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.27 
 
 
348 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.94 
 
 
324 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  42.37 
 
 
339 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  42.37 
 
 
339 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
308 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.41 
 
 
343 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.28 
 
 
339 aa  239  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.68 
 
 
321 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 
411 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.51 
 
 
319 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 
308 aa  237  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6125  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.44 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.79 
 
 
323 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  40.19 
 
 
339 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  41.61 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  39.75 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.05 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.27 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  43.79 
 
 
319 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.71 
 
 
279 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1532  ABC transporter related protein  45.14 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
266 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  40 
 
 
339 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  40.62 
 
 
320 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  38.16 
 
 
304 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  39.29 
 
 
338 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  37.74 
 
 
337 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.04 
 
 
316 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  37.74 
 
 
337 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1202  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 
315 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.0328977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0120  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.96 
 
 
338 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0230448  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  40.5 
 
 
340 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 
316 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  38.39 
 
 
338 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.82 
 
 
374 aa  226  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1957  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.92 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  41.04 
 
 
316 aa  225  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  40.63 
 
 
330 aa  225  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  40.31 
 
 
339 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 
317 aa  224  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.77 
 
 
330 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.96 
 
 
308 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41.91 
 
 
282 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.16 
 
 
342 aa  222  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.89 
 
 
371 aa  222  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.24 
 
 
360 aa  222  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0288  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.95 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467891  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  49.32 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  36.65 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  42.18 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  42.39 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.74 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  37.2 
 
 
338 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4993  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 
349 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.01 
 
 
321 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.8 
 
 
343 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 
255 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  41.94 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  38.75 
 
 
337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  40.98 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>