More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0012 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  72.4 
 
 
308 aa  474  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  72.4 
 
 
308 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  71.75 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  71.1 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  57.33 
 
 
308 aa  364  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 
328 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.31 
 
 
333 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
327 aa  256  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.59 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  46.73 
 
 
309 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
327 aa  249  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.45 
 
 
328 aa  249  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 
279 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 
327 aa  247  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.83 
 
 
322 aa  245  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.67 
 
 
316 aa  244  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.83 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.83 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  46.37 
 
 
329 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 
330 aa  242  6e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.04 
 
 
323 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 
324 aa  241  9e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 
266 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 
316 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.48 
 
 
343 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 
328 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.81 
 
 
321 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  41.56 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
324 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.25 
 
 
279 aa  238  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 
324 aa  234  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.88 
 
 
325 aa  235  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.87 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.67 
 
 
338 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.3 
 
 
324 aa  231  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.1 
 
 
329 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  42.24 
 
 
330 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 
338 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
345 aa  229  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
330 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
334 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 
329 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 
334 aa  225  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.29 
 
 
333 aa  224  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.87 
 
 
320 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
326 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.56 
 
 
323 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.14 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.61 
 
 
316 aa  220  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  37.19 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 
293 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  37.5 
 
 
344 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  42.16 
 
 
307 aa  215  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  39.81 
 
 
339 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  39.81 
 
 
339 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.37 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.71 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.1 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  38.96 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.66 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.3 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.57 
 
 
310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.02 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.21 
 
 
348 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.16 
 
 
325 aa  211  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.22 
 
 
321 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
255 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  39.43 
 
 
339 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  41.38 
 
 
300 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 
366 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.41 
 
 
366 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 
366 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 
307 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  38.34 
 
 
339 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 
312 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.48 
 
 
338 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  39.23 
 
 
303 aa  209  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  38.96 
 
 
314 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  38.39 
 
 
339 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  38.49 
 
 
339 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 
331 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  39.16 
 
 
314 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.78 
 
 
319 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.29 
 
 
319 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  41.23 
 
 
307 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 
334 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 
374 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  34.7 
 
 
338 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  44.8 
 
 
260 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.19 
 
 
312 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  34.19 
 
 
312 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  36.75 
 
 
305 aa  205  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  41.46 
 
 
319 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
305 aa  205  9e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.67 
 
 
312 aa  204  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>