More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3462 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  65.36 
 
 		 324 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  64.57 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  63.18 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  60.74 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  60.4 
 
 		 319 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  54.28 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  68.44 
 
 		 512 aa  332  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  63.49 
 
 		 510 aa  331  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  53.64 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  51.95 
 
 		 316 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  54.36 
 
 		 350 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  50.81 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  52.03 
 
 		 322 aa  305  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  49.51 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  48.83 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  51.31 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  48.16 
 
 		 314 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  44.19 
 
 		 667 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  46.46 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  53.78 
 
 		 582 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  56.02 
 
 		 581 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  51.1 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  54.09 
 
 		 585 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  47.7 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  52.36 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  44.59 
 
 		 312 aa  261  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  49.01 
 
 		 583 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  53.6 
 
 		 578 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 578 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  52.7 
 
 		 582 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 578 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 578 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  53.6 
 
 		 578 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 578 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 578 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 578 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  53.91 
 
 		 576 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  51.84 
 
 		 576 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  48.48 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  52.38 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  53.6 
 
 		 578 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  51.95 
 
 		 580 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 		 578 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  44.09 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  51.95 
 
 		 580 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 		 578 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 578 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 		 578 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  57.01 
 
 		 580 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  52.52 
 
 		 575 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 		 578 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  51.28 
 
 		 579 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  52.86 
 
 		 585 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  45.66 
 
 		 651 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  52.42 
 
 		 594 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  51.34 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  48.47 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  51.98 
 
 		 580 aa  255  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  44.97 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  54.02 
 
 		 275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  45.67 
 
 		 346 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  45.4 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  45.67 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  43.13 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  45.67 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  56.13 
 
 		 578 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  43.73 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.15 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  50.86 
 
 		 579 aa  248  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  52.27 
 
 		 580 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  41.12 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  43.79 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  43.42 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  50.62 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  53.81 
 
 		 590 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  43.61 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  53.36 
 
 		 590 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  43.85 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  52.27 
 
 		 580 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  44.52 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  53.64 
 
 		 255 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  43.09 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  42.19 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 1171 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.85 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  43.34 
 
 		 311 aa  241  7.999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 		 312 aa  241  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  43.23 
 
 		 323 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  41.91 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 583 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  43.52 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 541 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>