More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1800 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  70.19 
 
 
311 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  69.01 
 
 
310 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  69.01 
 
 
310 aa  434  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  62.9 
 
 
306 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  61.11 
 
 
326 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  61.44 
 
 
339 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  61.54 
 
 
332 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.46 
 
 
317 aa  374  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  59.69 
 
 
340 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  57.19 
 
 
328 aa  351  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  55.02 
 
 
317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  52.96 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  52.4 
 
 
315 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  48.05 
 
 
305 aa  297  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  51 
 
 
293 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  48.56 
 
 
310 aa  291  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  49.01 
 
 
302 aa  288  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  49.35 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  46.96 
 
 
323 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  47.9 
 
 
305 aa  286  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  48.15 
 
 
303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  47.44 
 
 
304 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  47.44 
 
 
351 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  47.44 
 
 
351 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  46.95 
 
 
304 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  47.44 
 
 
304 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  46.95 
 
 
304 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  47.44 
 
 
304 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  47.44 
 
 
306 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  47.27 
 
 
327 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  47.42 
 
 
344 aa  279  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  47.12 
 
 
304 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  46.3 
 
 
304 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  50.96 
 
 
313 aa  275  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  46.82 
 
 
321 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  45.81 
 
 
320 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  46.77 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  46.77 
 
 
304 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  49.16 
 
 
345 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  46.13 
 
 
373 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  47.33 
 
 
325 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  46.41 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  47.13 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  45.83 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  44.94 
 
 
313 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  46.5 
 
 
320 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  48.04 
 
 
322 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  46.05 
 
 
304 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  46.08 
 
 
304 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  47.87 
 
 
301 aa  267  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  47.04 
 
 
355 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  45.28 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  48.87 
 
 
311 aa  265  7e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  48.23 
 
 
309 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  46.43 
 
 
307 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  48.23 
 
 
309 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  48.52 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  44.73 
 
 
307 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  45.72 
 
 
314 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
311 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  46.73 
 
 
304 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  46.49 
 
 
342 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  45.16 
 
 
304 aa  255  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  44.82 
 
 
323 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  45.6 
 
 
304 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 
315 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.03 
 
 
334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  42.43 
 
 
308 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  43 
 
 
305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.14 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  43.95 
 
 
305 aa  232  5e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.74 
 
 
282 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
324 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  42.35 
 
 
305 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
324 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.17 
 
 
327 aa  226  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.74 
 
 
338 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.8 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.75 
 
 
343 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.64 
 
 
339 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.53 
 
 
327 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.99 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.24 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.41 
 
 
321 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 
327 aa  215  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.58 
 
 
308 aa  215  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.68 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.34 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.91 
 
 
316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.58 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.37 
 
 
319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.54 
 
 
323 aa  212  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.4 
 
 
324 aa  212  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.43 
 
 
325 aa  212  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.88 
 
 
329 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.57 
 
 
329 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.75 
 
 
322 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>