More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2448 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  100 
 
 
314 aa  636    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  61.11 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  48.43 
 
 
324 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  50.47 
 
 
322 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 
320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  50.99 
 
 
319 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  49.34 
 
 
316 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  48.33 
 
 
314 aa  298  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  49.84 
 
 
350 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  51.68 
 
 
319 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  49 
 
 
333 aa  295  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  51.53 
 
 
325 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 
309 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  48.16 
 
 
308 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  47.4 
 
 
315 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  49.16 
 
 
319 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  59.15 
 
 
512 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
312 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  53.98 
 
 
510 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  45.22 
 
 
322 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  44.95 
 
 
314 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  43.93 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  45.48 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  41.96 
 
 
326 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  51.13 
 
 
255 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  50.62 
 
 
582 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  42.01 
 
 
326 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  42.62 
 
 
318 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  50.2 
 
 
581 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 
309 aa  248  8e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
312 aa  248  8e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  42.35 
 
 
311 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  43.28 
 
 
321 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  48.57 
 
 
594 aa  246  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  42.05 
 
 
305 aa  245  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 
580 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  48.76 
 
 
580 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  49.17 
 
 
578 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  47.35 
 
 
590 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  41.99 
 
 
311 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 
315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  48.96 
 
 
583 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  43.52 
 
 
316 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  45.12 
 
 
346 aa  242  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  48.35 
 
 
578 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
578 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  48.35 
 
 
578 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 
322 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  41.08 
 
 
308 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  46.94 
 
 
590 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
578 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.35 
 
 
578 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  48.35 
 
 
578 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
578 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
578 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.24 
 
 
311 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
308 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  42.57 
 
 
323 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
578 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  41.56 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  43.71 
 
 
311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  48.37 
 
 
248 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  44.93 
 
 
346 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  40.2 
 
 
312 aa  239  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  43.23 
 
 
318 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  45.39 
 
 
346 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  48.16 
 
 
585 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  47.11 
 
 
580 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  43.41 
 
 
313 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  45.3 
 
 
317 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  43 
 
 
302 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  43.51 
 
 
317 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  39.69 
 
 
354 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  43.55 
 
 
314 aa  236  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  47.11 
 
 
576 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.45 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 
305 aa  235  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  46.69 
 
 
580 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  47.11 
 
 
575 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  45.3 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  49.78 
 
 
593 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  45.3 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  45.3 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  46.89 
 
 
582 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  41.48 
 
 
323 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  40 
 
 
323 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  47.09 
 
 
247 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  40.13 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  45.76 
 
 
316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.46 
 
 
667 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.48 
 
 
308 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  41.67 
 
 
335 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 
578 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  45.3 
 
 
318 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  46.89 
 
 
585 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  38.56 
 
 
307 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  46.89 
 
 
576 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>