More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00778 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  100 
 
 
578 aa  1188    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  73.99 
 
 
580 aa  855    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  74.18 
 
 
582 aa  867    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  99.83 
 
 
578 aa  1184    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  99.83 
 
 
578 aa  1184    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  91.18 
 
 
578 aa  1091    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  91.18 
 
 
578 aa  1091    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  99.83 
 
 
578 aa  1184    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  89.45 
 
 
579 aa  1068    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  56.75 
 
 
578 aa  671    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  58.2 
 
 
580 aa  672    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  58.02 
 
 
580 aa  672    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  74.56 
 
 
580 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  56.99 
 
 
585 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  91 
 
 
578 aa  1089    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  99.65 
 
 
578 aa  1182    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  91.18 
 
 
578 aa  1091    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  99.48 
 
 
578 aa  1180    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  99.31 
 
 
578 aa  1178    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  74.56 
 
 
580 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  73.12 
 
 
583 aa  868    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  57.69 
 
 
581 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  74.69 
 
 
576 aa  872    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  56.29 
 
 
575 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  56.38 
 
 
582 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  73.46 
 
 
585 aa  849    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  58.38 
 
 
590 aa  674    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1188    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  90.83 
 
 
578 aa  1088    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  56.72 
 
 
576 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  99.48 
 
 
578 aa  1181    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  57.69 
 
 
594 aa  672    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  57.77 
 
 
590 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  56.29 
 
 
580 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  53.06 
 
 
579 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  49.34 
 
 
617 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  53.16 
 
 
578 aa  558  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  50.63 
 
 
599 aa  551  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  49.38 
 
 
592 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 
592 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  48.55 
 
 
593 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  48.53 
 
 
593 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  47.49 
 
 
588 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
583 aa  508  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  45.69 
 
 
587 aa  502  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  47.29 
 
 
599 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
589 aa  503  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
551 aa  495  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  45.22 
 
 
1106 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
541 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43.96 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.32 
 
 
667 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.21 
 
 
914 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  38.8 
 
 
651 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  39.57 
 
 
915 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  37.63 
 
 
920 aa  343  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.88 
 
 
913 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  36.55 
 
 
912 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.23 
 
 
924 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  38.09 
 
 
904 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  37.5 
 
 
912 aa  334  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  35.86 
 
 
927 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  37.55 
 
 
912 aa  332  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  37.15 
 
 
912 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  38.16 
 
 
901 aa  329  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  37.82 
 
 
917 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  36.89 
 
 
933 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  34.89 
 
 
912 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  36.65 
 
 
936 aa  325  9e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  36.65 
 
 
936 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  34.6 
 
 
928 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  35.83 
 
 
930 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  35.69 
 
 
914 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  36.99 
 
 
911 aa  312  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  52.11 
 
 
1171 aa  279  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  51.46 
 
 
512 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  53.6 
 
 
308 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  53.98 
 
 
314 aa  257  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
312 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  55.3 
 
 
333 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  52 
 
 
324 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  51.69 
 
 
320 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  32.42 
 
 
943 aa  252  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  52.7 
 
 
319 aa  251  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  51.09 
 
 
325 aa  250  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  48.55 
 
 
248 aa  249  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  50.91 
 
 
247 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  46.05 
 
 
916 aa  248  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  47.35 
 
 
270 aa  247  4.9999999999999997e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  51.53 
 
 
319 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  31.49 
 
 
926 aa  246  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  49.17 
 
 
275 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  30.5 
 
 
922 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  50.9 
 
 
316 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  52.8 
 
 
322 aa  242  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  48.35 
 
 
314 aa  241  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  47.2 
 
 
255 aa  240  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  30.45 
 
 
994 aa  240  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  46.91 
 
 
257 aa  239  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
350 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>