More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001403 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  100 
 
 		 308 aa  635    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  91.56 
 
 		 308 aa  587  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  77.6 
 
 		 308 aa  508  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  63.16 
 
 		 322 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  62.05 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  62.09 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  60.86 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  60.53 
 
 		 317 aa  394  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  60.4 
 
 		 346 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  60.86 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  60.86 
 
 		 318 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  60.53 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  59.93 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  60.13 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  59.87 
 
 		 323 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  57.41 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  60.13 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.14 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  51.47 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  44.82 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  45.15 
 
 		 316 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  44.26 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  44.22 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  42.76 
 
 		 325 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  41.16 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  42.53 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.47 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  41.58 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  39.8 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  42.05 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  41.55 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  41.61 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.95 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  42.3 
 
 		 309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  40.33 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  46.94 
 
 		 304 aa  244  9e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.09 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  40.86 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  40.74 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  40.67 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  47.37 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  50.22 
 
 		 510 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  39.6 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.87 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  40.06 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  45.08 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  45.45 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  45.04 
 
 		 323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  41.14 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  39.8 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  43.29 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.26 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  39.27 
 
 		 313 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  38.96 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  40.26 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  44.83 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  39.48 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  45.85 
 
 		 247 aa  232  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  39.87 
 
 		 312 aa  231  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  47.71 
 
 		 512 aa  231  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  45.37 
 
 		 580 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 580 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  48.44 
 
 		 589 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  37.25 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  44.81 
 
 		 909 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 		 576 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  47 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  45.61 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  49.53 
 
 		 578 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  38.51 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 583 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  37.74 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  44.78 
 
 		 904 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  45.05 
 
 		 593 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  47.77 
 
 		 599 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  42.28 
 
 		 594 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  39.68 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  38.21 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  40.67 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  43.61 
 
 		 583 aa  222  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  40 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  46.43 
 
 		 932 aa  221  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  39.24 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  40.2 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  39.13 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  42.4 
 
 		 582 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  43.29 
 
 		 921 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  45.7 
 
 		 590 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  45.7 
 
 		 590 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  47 
 
 		 576 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>