More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2512 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  73.12 
 
 		 578 aa  868    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  73.12 
 
 		 578 aa  868    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  73.6 
 
 		 578 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  73.6 
 
 		 578 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  57.09 
 
 		 578 aa  666    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  77.19 
 
 		 576 aa  918    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  72.77 
 
 		 578 aa  863    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  85.17 
 
 		 582 aa  1012    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  58.88 
 
 		 590 aa  677    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  56.57 
 
 		 580 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  73.6 
 
 		 578 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  56.57 
 
 		 580 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  73.51 
 
 		 579 aa  864    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  100 
 
 		 583 aa  1186    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  80.94 
 
 		 585 aa  958    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  58.06 
 
 		 582 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  57.12 
 
 		 580 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  58.74 
 
 		 590 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  73.12 
 
 		 578 aa  868    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  73.51 
 
 		 578 aa  867    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  73.12 
 
 		 578 aa  867    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  57.91 
 
 		 575 aa  685    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  73.6 
 
 		 578 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  77.19 
 
 		 580 aa  918    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  77.19 
 
 		 580 aa  918    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  80.59 
 
 		 580 aa  955    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  58.42 
 
 		 581 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  58.76 
 
 		 585 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  58.64 
 
 		 576 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  73.6 
 
 		 578 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  73.12 
 
 		 578 aa  868    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  59.54 
 
 		 594 aa  692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  73.12 
 
 		 578 aa  868    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  73.12 
 
 		 578 aa  868    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  50.51 
 
 		 579 aa  568  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  52.75 
 
 		 578 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  50.68 
 
 		 617 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  48.9 
 
 		 593 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  50.09 
 
 		 599 aa  541  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  49.58 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  50 
 
 		 599 aa  521  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  50.9 
 
 		 593 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  46.22 
 
 		 587 aa  513  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  48.17 
 
 		 588 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 551 aa  501  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 583 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  44.46 
 
 		 589 aa  495  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  42.64 
 
 		 1106 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  42.88 
 
 		 510 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.61 
 
 		 651 aa  405  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.32 
 
 		 667 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.59 
 
 		 914 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.3 
 
 		 907 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  38.6 
 
 		 915 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  36.8 
 
 		 920 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  39.22 
 
 		 916 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  36.69 
 
 		 922 aa  356  5.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  37.88 
 
 		 921 aa  353  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  38.39 
 
 		 916 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.69 
 
 		 924 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  37.37 
 
 		 911 aa  349  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  37.37 
 
 		 911 aa  349  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  37.37 
 
 		 911 aa  349  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  37.37 
 
 		 911 aa  349  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  37.37 
 
 		 911 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  38.96 
 
 		 901 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  37.37 
 
 		 911 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  37.37 
 
 		 911 aa  349  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  37.37 
 
 		 911 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.31 
 
 		 916 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  38.69 
 
 		 901 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38 
 
 		 1017 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  37.37 
 
 		 911 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  38.96 
 
 		 901 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.44 
 
 		 1071 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.44 
 
 		 1071 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.44 
 
 		 1079 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  37.71 
 
 		 929 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  38.37 
 
 		 1066 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  38.27 
 
 		 1089 aa  343  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  36.69 
 
 		 913 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.36 
 
 		 1082 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  37.68 
 
 		 913 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  37.68 
 
 		 913 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  37.8 
 
 		 927 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  35.33 
 
 		 918 aa  336  9e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  37.38 
 
 		 943 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  36.21 
 
 		 928 aa  332  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  34.41 
 
 		 935 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  37.39 
 
 		 936 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  34.4 
 
 		 932 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  35.47 
 
 		 994 aa  293  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.22 
 
 		 913 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  34.89 
 
 		 912 aa  279  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 1171 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  34.08 
 
 		 901 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  50.21 
 
 		 512 aa  266  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  34.68 
 
 		 913 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>