More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1792 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.29 
 
 
578 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  56.47 
 
 
578 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  56.29 
 
 
578 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  58.52 
 
 
582 aa  669    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  55.67 
 
 
578 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  55.85 
 
 
578 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  57.89 
 
 
576 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  58 
 
 
585 aa  655    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  56.47 
 
 
578 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  55.67 
 
 
579 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  56.62 
 
 
580 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  56.37 
 
 
580 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  56.47 
 
 
578 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  75.04 
 
 
581 aa  827    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  56.29 
 
 
578 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  100 
 
 
580 aa  1157    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  59.04 
 
 
590 aa  658    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  55.85 
 
 
578 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  57.47 
 
 
580 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  56.47 
 
 
578 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  60.5 
 
 
575 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  57.89 
 
 
590 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  56.14 
 
 
580 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  75.66 
 
 
585 aa  822    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  59.2 
 
 
594 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  55.85 
 
 
578 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  76.83 
 
 
576 aa  853    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  57.12 
 
 
583 aa  657    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  56.12 
 
 
578 aa  648    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  55.67 
 
 
578 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  60.76 
 
 
578 aa  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  56.14 
 
 
580 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  75.13 
 
 
582 aa  842    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  56.29 
 
 
578 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  55.11 
 
 
578 aa  568  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  52.93 
 
 
599 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 
579 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 
592 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  49.66 
 
 
592 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  49.75 
 
 
593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  49.59 
 
 
617 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  48.38 
 
 
588 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 
551 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  48.25 
 
 
599 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  49.31 
 
 
593 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  46.03 
 
 
587 aa  496  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  44.46 
 
 
589 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
541 aa  483  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  44.88 
 
 
583 aa  482  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  47.73 
 
 
1106 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  39.5 
 
 
651 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.26 
 
 
667 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  38.18 
 
 
922 aa  351  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.52 
 
 
914 aa  349  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  39.86 
 
 
912 aa  349  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  40.66 
 
 
904 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  39.11 
 
 
916 aa  342  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  38.54 
 
 
927 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  38.68 
 
 
921 aa  334  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  36.03 
 
 
921 aa  332  8e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  37.5 
 
 
930 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  37.85 
 
 
906 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  36.32 
 
 
928 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  53.53 
 
 
512 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  35.34 
 
 
912 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  54.51 
 
 
1171 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  53.42 
 
 
319 aa  267  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  34.89 
 
 
912 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  57.01 
 
 
308 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  55.09 
 
 
319 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  53.14 
 
 
333 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 
320 aa  256  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  45.29 
 
 
510 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  45.63 
 
 
901 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  54.67 
 
 
312 aa  249  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  45.31 
 
 
901 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  55.71 
 
 
314 aa  249  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  54.79 
 
 
322 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  52.42 
 
 
325 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  50.68 
 
 
324 aa  243  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  45.89 
 
 
901 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 
350 aa  242  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  49.32 
 
 
248 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 
257 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  53.18 
 
 
316 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  46.3 
 
 
323 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  49.4 
 
 
920 aa  237  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  50.45 
 
 
319 aa  237  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  53.18 
 
 
322 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  47.48 
 
 
247 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  50.92 
 
 
309 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  43.79 
 
 
308 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  50.21 
 
 
994 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  44.67 
 
 
912 aa  233  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  52.42 
 
 
314 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  50 
 
 
307 aa  233  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  52.68 
 
 
328 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  45.08 
 
 
270 aa  232  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  46.91 
 
 
917 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  53.02 
 
 
322 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>