More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0316 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  70.78 
 
 		 911 aa  1275    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  70.78 
 
 		 911 aa  1275    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  72.88 
 
 		 911 aa  1289    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  58.04 
 
 		 912 aa  1009    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  68.74 
 
 		 930 aa  1218    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  73.02 
 
 		 994 aa  756    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.84 
 
 		 906 aa  998    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.33 
 
 		 907 aa  988    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  58.31 
 
 		 916 aa  1019    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  55.91 
 
 		 901 aa  930    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.92 
 
 		 913 aa  966    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  64.76 
 
 		 922 aa  1196    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  66.24 
 
 		 936 aa  1195    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  71 
 
 		 911 aa  1279    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  58.15 
 
 		 912 aa  997    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  74.07 
 
 		 1071 aa  740    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  67.72 
 
 		 929 aa  1192    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  63.61 
 
 		 920 aa  1163    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  68.54 
 
 		 927 aa  1235    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  74.07 
 
 		 1082 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  69.96 
 
 		 913 aa  1266    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  56.4 
 
 		 906 aa  974    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  56.06 
 
 		 901 aa  938    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  74.07 
 
 		 1089 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  70.78 
 
 		 911 aa  1275    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.21 
 
 		 914 aa  968    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  67.51 
 
 		 918 aa  1192    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  100 
 
 		 901 aa  1814    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  62.77 
 
 		 942 aa  1095    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  69.96 
 
 		 913 aa  1267    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  56.73 
 
 		 906 aa  998    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  70.78 
 
 		 911 aa  1275    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  57.58 
 
 		 912 aa  992    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  60.15 
 
 		 904 aa  1036    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  51.96 
 
 		 942 aa  879    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.07 
 
 		 913 aa  1268    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  73.49 
 
 		 1017 aa  746    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  74.07 
 
 		 1079 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  58.26 
 
 		 912 aa  1002    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  56.74 
 
 		 906 aa  999    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  65.5 
 
 		 925 aa  1203    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  74.07 
 
 		 1066 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  70.56 
 
 		 911 aa  1267    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  65.93 
 
 		 922 aa  1187    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  65.26 
 
 		 930 aa  1165    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  65.54 
 
 		 933 aa  1222    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  66.3 
 
 		 930 aa  1173    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  65.67 
 
 		 927 aa  1187    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  67 
 
 		 921 aa  1216    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  59.69 
 
 		 911 aa  1015    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  66.04 
 
 		 924 aa  1178    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  65.8 
 
 		 927 aa  1142    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  58.77 
 
 		 915 aa  1064    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  67 
 
 		 921 aa  1199    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  68.29 
 
 		 908 aa  1192    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  56.01 
 
 		 901 aa  936    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  65.31 
 
 		 919 aa  1177    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  64.22 
 
 		 926 aa  1186    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  56.3 
 
 		 935 aa  1022    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  64.07 
 
 		 936 aa  1110    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  70.78 
 
 		 911 aa  1276    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  56.96 
 
 		 918 aa  1045    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  59.57 
 
 		 943 aa  1078    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  55.27 
 
 		 928 aa  986    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  72.94 
 
 		 916 aa  1301    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  72.91 
 
 		 916 aa  1289    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  70.78 
 
 		 911 aa  1276    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  70.56 
 
 		 911 aa  1272    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.07 
 
 		 913 aa  1268    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  65.56 
 
 		 912 aa  1130    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  58.25 
 
 		 932 aa  1038    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  66.45 
 
 		 914 aa  1207    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  62.33 
 
 		 909 aa  1075    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  58.21 
 
 		 917 aa  1045    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  66.24 
 
 		 936 aa  1196    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  74.07 
 
 		 1071 aa  740    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  38.32 
 
 		 651 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.68 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.55 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  38.39 
 
 		 590 aa  342  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 		 541 aa  341  4e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  37.61 
 
 		 575 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  37.34 
 
 		 587 aa  329  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  36.1 
 
 		 578 aa  324  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  36.58 
 
 		 590 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  31.39 
 
 		 691 aa  280  8e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 		 551 aa  280  8e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  34.08 
 
 		 583 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  43 
 
 		 576 aa  232  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  29.88 
 
 		 578 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  29.88 
 
 		 578 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  36.9 
 
 		 384 aa  231  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  29.71 
 
 		 578 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  29.71 
 
 		 578 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  42.71 
 
 		 582 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  43.38 
 
 		 599 aa  228  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  48.1 
 
 		 594 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.16 
 
 		 580 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  29.49 
 
 		 578 aa  225  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 		 580 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>