More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2838 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  52.78 
 
 
1106 aa  1019    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
1171 aa  2304    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  44.13 
 
 
617 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  53.26 
 
 
371 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  53.26 
 
 
371 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  54.48 
 
 
387 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  51.3 
 
 
385 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  51.69 
 
 
374 aa  353  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  32.55 
 
 
920 aa  343  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  48.43 
 
 
382 aa  343  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  36.38 
 
 
994 aa  341  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  44.88 
 
 
379 aa  334  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  46.32 
 
 
378 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  57.88 
 
 
599 aa  330  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  32.84 
 
 
1017 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  45.69 
 
 
379 aa  313  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  43.08 
 
 
377 aa  311  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  44.39 
 
 
376 aa  311  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  44.1 
 
 
377 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  44.1 
 
 
377 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  44.1 
 
 
377 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  44.1 
 
 
377 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  44.1 
 
 
377 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  44.1 
 
 
377 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  44.1 
 
 
377 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  44.1 
 
 
377 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  32.69 
 
 
925 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  53.71 
 
 
593 aa  310  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  44.13 
 
 
376 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  43.85 
 
 
377 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  44.13 
 
 
376 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  44.13 
 
 
376 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  44.13 
 
 
376 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  44.21 
 
 
375 aa  308  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  43.34 
 
 
375 aa  307  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  41.99 
 
 
373 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  30.55 
 
 
935 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  41.73 
 
 
373 aa  305  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  42.67 
 
 
391 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  30.9 
 
 
928 aa  304  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  41.36 
 
 
391 aa  303  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  46.53 
 
 
389 aa  301  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  31.84 
 
 
930 aa  301  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  42.93 
 
 
384 aa  301  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  61.13 
 
 
588 aa  300  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  45.41 
 
 
379 aa  300  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  60.71 
 
 
579 aa  297  9e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  56.03 
 
 
592 aa  296  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  56.03 
 
 
592 aa  296  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  46.29 
 
 
389 aa  295  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  44.91 
 
 
381 aa  295  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  42.67 
 
 
391 aa  295  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  46.19 
 
 
389 aa  295  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  43.57 
 
 
376 aa  293  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  42.67 
 
 
391 aa  293  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  59.13 
 
 
593 aa  291  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  55.33 
 
 
578 aa  288  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  41.09 
 
 
368 aa  288  4e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  55.81 
 
 
594 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  48.6 
 
 
583 aa  285  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  42.54 
 
 
384 aa  285  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  56.1 
 
 
585 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
589 aa  284  8.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  57.92 
 
 
590 aa  282  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  57.92 
 
 
590 aa  282  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  60.08 
 
 
599 aa  280  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  56.56 
 
 
582 aa  280  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  52.11 
 
 
578 aa  280  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  56.23 
 
 
587 aa  280  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  52.11 
 
 
578 aa  280  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  52.11 
 
 
578 aa  280  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  51.34 
 
 
579 aa  280  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  52.11 
 
 
578 aa  280  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  52.11 
 
 
578 aa  280  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  52.11 
 
 
578 aa  280  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  52.11 
 
 
578 aa  279  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  52.11 
 
 
578 aa  280  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  52.11 
 
 
578 aa  280  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  38.44 
 
 
375 aa  278  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  56.33 
 
 
576 aa  279  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  55.79 
 
 
581 aa  278  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  41.79 
 
 
387 aa  277  7e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  53.94 
 
 
575 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  52.87 
 
 
582 aa  275  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  51.34 
 
 
578 aa  274  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  51.34 
 
 
578 aa  274  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  42.49 
 
 
375 aa  273  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  51.34 
 
 
578 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 
578 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  51.34 
 
 
578 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  53.28 
 
 
583 aa  273  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  53.88 
 
 
578 aa  272  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  44.87 
 
 
377 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  49.43 
 
 
580 aa  271  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
580 aa  271  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  51.22 
 
 
580 aa  271  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 
364 aa  271  5.9999999999999995e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  44.97 
 
 
380 aa  271  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  38.08 
 
 
375 aa  270  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  50 
 
 
576 aa  270  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>