More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1303 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  91.52 
 
 
389 aa  677    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  100 
 
 
389 aa  764    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  93.06 
 
 
389 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  82.49 
 
 
377 aa  557  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  57.77 
 
 
376 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  56.79 
 
 
375 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  56.68 
 
 
375 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  55.86 
 
 
378 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  56.79 
 
 
384 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  51.34 
 
 
373 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  51.34 
 
 
373 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  45.78 
 
 
391 aa  352  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  44.99 
 
 
391 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  48.66 
 
 
391 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  45.48 
 
 
376 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  45.48 
 
 
376 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  45.48 
 
 
376 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  45.48 
 
 
376 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  45.48 
 
 
376 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  48.94 
 
 
379 aa  348  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  45.26 
 
 
377 aa  348  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  48.39 
 
 
391 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  47.31 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  48.4 
 
 
381 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  45.14 
 
 
379 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  49.34 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  47.93 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  47.93 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  47.93 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  47.93 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  47.93 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  47.93 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  47.93 
 
 
377 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  47.93 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  47.63 
 
 
377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  48.01 
 
 
375 aa  332  9e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  46.26 
 
 
371 aa  326  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  46.26 
 
 
371 aa  326  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  47.99 
 
 
374 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  45.23 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  43.97 
 
 
385 aa  316  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  45.01 
 
 
387 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 
364 aa  295  8e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  41.13 
 
 
382 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  43.34 
 
 
1106 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  46.19 
 
 
1171 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  42.36 
 
 
405 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  39.95 
 
 
368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  39.37 
 
 
378 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  38.18 
 
 
377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  38.8 
 
 
378 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  40.64 
 
 
369 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  36.66 
 
 
375 aa  248  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  39.73 
 
 
377 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  36.66 
 
 
375 aa  246  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
377 aa  246  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  40.35 
 
 
377 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  40.4 
 
 
377 aa  242  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  38.61 
 
 
380 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  37.9 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  38.56 
 
 
378 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 
378 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 
377 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  38.32 
 
 
377 aa  236  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 
366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  34.82 
 
 
427 aa  205  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 
376 aa  196  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  34.71 
 
 
376 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 
376 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  33.07 
 
 
379 aa  193  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 
376 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  37.92 
 
 
381 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  34.86 
 
 
373 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 
380 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 
377 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  33.25 
 
 
376 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 
368 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  34.41 
 
 
369 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 
368 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
376 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  32.36 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  34.39 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  31.99 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  38.81 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 
367 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 
390 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 
371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  32.38 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 
375 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  36.6 
 
 
380 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 
382 aa  179  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 
383 aa  179  9e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  31.56 
 
 
913 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  31.55 
 
 
913 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  31.55 
 
 
913 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  31.65 
 
 
911 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>