More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3105 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  100 
 
 
427 aa  847    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  59.86 
 
 
378 aa  495  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  57.69 
 
 
377 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  56.46 
 
 
377 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  53.48 
 
 
377 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  53.98 
 
 
377 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  53.35 
 
 
377 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  49.88 
 
 
405 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  44.71 
 
 
369 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  41.11 
 
 
379 aa  300  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  40.14 
 
 
377 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  39.04 
 
 
378 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  38.22 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  38.85 
 
 
371 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  38.85 
 
 
371 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  37.76 
 
 
375 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  39.09 
 
 
381 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 
378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  35.59 
 
 
366 aa  263  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  36.78 
 
 
375 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  36.54 
 
 
369 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  39.76 
 
 
376 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  37.23 
 
 
373 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  36.19 
 
 
376 aa  259  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  35.45 
 
 
379 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  36.69 
 
 
380 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  37.08 
 
 
374 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  38.81 
 
 
378 aa  256  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  35.55 
 
 
382 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 
376 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  37.02 
 
 
376 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  37.41 
 
 
376 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  35.89 
 
 
391 aa  246  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 
369 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  34.45 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  35.28 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  34.45 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  34.45 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  34.45 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  34.45 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  36.3 
 
 
376 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  34.89 
 
 
391 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 
375 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  35.96 
 
 
376 aa  243  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  37.41 
 
 
380 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  37.38 
 
 
380 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  38.41 
 
 
380 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  37.2 
 
 
387 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 
377 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  33.79 
 
 
384 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  37.67 
 
 
384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  35.84 
 
 
370 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  36.86 
 
 
1171 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  34.45 
 
 
376 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 
381 aa  233  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  34.86 
 
 
376 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  34.35 
 
 
377 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.35 
 
 
377 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  34.35 
 
 
377 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  34.35 
 
 
377 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  34.35 
 
 
377 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  34.35 
 
 
377 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  34.35 
 
 
377 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  34.35 
 
 
377 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  33.88 
 
 
391 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 
379 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  34.35 
 
 
377 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  36.3 
 
 
369 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 
377 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 
391 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 
368 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 
376 aa  226  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  36.12 
 
 
375 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
364 aa  225  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 
375 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  34.98 
 
 
389 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  33.72 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  34.39 
 
 
1106 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  35.08 
 
 
357 aa  219  5e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  35.89 
 
 
378 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  33.72 
 
 
373 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  32.62 
 
 
375 aa  219  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 
389 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  34.86 
 
 
377 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 
368 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  38.07 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  35.34 
 
 
378 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  34.24 
 
 
385 aa  213  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 
371 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  31.83 
 
 
383 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  32.29 
 
 
906 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  32.05 
 
 
906 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  33.85 
 
 
380 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.81 
 
 
906 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  34.61 
 
 
377 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  34.84 
 
 
387 aa  206  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>