More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3461 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  724    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  55.59 
 
 
377 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  53.72 
 
 
377 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  54.38 
 
 
378 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  51.86 
 
 
377 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  49.6 
 
 
405 aa  359  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  49.73 
 
 
377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  49.73 
 
 
377 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  45.36 
 
 
378 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  43.16 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  43.16 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  44.82 
 
 
427 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  42.48 
 
 
379 aa  298  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  41.91 
 
 
378 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  41.47 
 
 
376 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  41.03 
 
 
375 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  42.97 
 
 
377 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  40.8 
 
 
378 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 
378 aa  291  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  41.67 
 
 
379 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  40 
 
 
375 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  44.47 
 
 
387 aa  288  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  43.47 
 
 
373 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  41.21 
 
 
377 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  40.86 
 
 
382 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  43.79 
 
 
377 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  43.79 
 
 
377 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  43.79 
 
 
377 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  43.79 
 
 
377 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  43.79 
 
 
377 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  43.79 
 
 
377 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  43.79 
 
 
377 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  43.79 
 
 
377 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  43.79 
 
 
377 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  40.75 
 
 
385 aa  277  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  40.92 
 
 
376 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  40.92 
 
 
376 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  40.92 
 
 
376 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  40.92 
 
 
376 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  40.92 
 
 
376 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  43.01 
 
 
384 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  42.55 
 
 
391 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  41.29 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  43.05 
 
 
384 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  42.55 
 
 
391 aa  272  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  41.19 
 
 
377 aa  272  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  42.01 
 
 
374 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  39.84 
 
 
369 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  43.47 
 
 
376 aa  270  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  39.07 
 
 
376 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 
364 aa  266  4e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  41.92 
 
 
379 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  40.43 
 
 
376 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  41.88 
 
 
376 aa  262  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  41.58 
 
 
391 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  41.58 
 
 
391 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  40.86 
 
 
375 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  39.19 
 
 
369 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  42.12 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  38.79 
 
 
377 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  39.1 
 
 
376 aa  258  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  38.56 
 
 
376 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  40.87 
 
 
1171 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 
366 aa  256  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  40.48 
 
 
376 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  42.56 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  35.17 
 
 
383 aa  253  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  38.86 
 
 
373 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  38.86 
 
 
373 aa  252  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  38.89 
 
 
376 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  39.95 
 
 
389 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  40.38 
 
 
389 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  37.97 
 
 
375 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  40.76 
 
 
381 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 
375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  41.46 
 
 
378 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  40.11 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  40.53 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 
370 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  38.04 
 
 
357 aa  243  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 
368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  39.47 
 
 
380 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  39.47 
 
 
380 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  38.5 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  39.45 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  33.79 
 
 
368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  36.2 
 
 
1106 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  38.79 
 
 
376 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  36.48 
 
 
378 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  40.48 
 
 
377 aa  232  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  36.24 
 
 
390 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  36.66 
 
 
381 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 
376 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  37.17 
 
 
375 aa  226  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  37.27 
 
 
383 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  36.49 
 
 
368 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  37.27 
 
 
383 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  36.93 
 
 
384 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 
368 aa  222  7e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>