More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1589 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  100 
 
 
369 aa  732    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  72.55 
 
 
369 aa  542  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  45.07 
 
 
379 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  43.82 
 
 
380 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  41.42 
 
 
370 aa  316  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  41.6 
 
 
376 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  41.24 
 
 
381 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  42.13 
 
 
376 aa  305  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  43.99 
 
 
369 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40.43 
 
 
384 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  41.62 
 
 
390 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  41.82 
 
 
382 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  40.54 
 
 
374 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  41.58 
 
 
367 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 
384 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  40.7 
 
 
384 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 
384 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  42.9 
 
 
378 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  39.47 
 
 
387 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  42.12 
 
 
371 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  39.63 
 
 
388 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  40 
 
 
378 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.35 
 
 
365 aa  292  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  40.54 
 
 
380 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  44.29 
 
 
366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 
377 aa  288  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  43.52 
 
 
390 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  42.26 
 
 
381 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  37.7 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  41.53 
 
 
366 aa  285  7e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  38.03 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  42.7 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  42.06 
 
 
366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  37.57 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  41.71 
 
 
373 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  40.87 
 
 
378 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  38.48 
 
 
378 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  40.98 
 
 
369 aa  279  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  39.01 
 
 
375 aa  275  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 
370 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  41.58 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  40.65 
 
 
385 aa  271  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 
373 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  40.27 
 
 
390 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  37.5 
 
 
382 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  39.3 
 
 
385 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  38.77 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  39.9 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  39.63 
 
 
373 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  39.63 
 
 
373 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  39.63 
 
 
373 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  37.53 
 
 
376 aa  269  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  39.15 
 
 
373 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  38.13 
 
 
377 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  38.3 
 
 
376 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 
376 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  39.42 
 
 
373 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  39.42 
 
 
373 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  39.15 
 
 
373 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
382 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  36.06 
 
 
376 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 
375 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  39.19 
 
 
369 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
377 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  39.46 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  39.24 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  36.36 
 
 
377 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  37.73 
 
 
376 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  39.15 
 
 
380 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  34.67 
 
 
378 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 
405 aa  252  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 
377 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  37.67 
 
 
381 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  37.57 
 
 
378 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 
373 aa  242  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 
377 aa  242  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  35.75 
 
 
377 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 
377 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  35.05 
 
 
366 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  33.86 
 
 
378 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 
373 aa  238  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  32.47 
 
 
376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 
368 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 
376 aa  230  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  36.31 
 
 
364 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  34.69 
 
 
691 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
379 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  34.48 
 
 
377 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  32.7 
 
 
368 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 
427 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  33.95 
 
 
378 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  33.96 
 
 
375 aa  216  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 
368 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
378 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  33.78 
 
 
376 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.85 
 
 
378 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
370 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  33.6 
 
 
382 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  32.7 
 
 
369 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>