More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2927 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  88.8 
 
 
377 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  100 
 
 
378 aa  757    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  88.27 
 
 
377 aa  629  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  65.51 
 
 
371 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  53.89 
 
 
374 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  49.47 
 
 
378 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  46.79 
 
 
381 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  51.85 
 
 
390 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  50.26 
 
 
379 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  50.94 
 
 
378 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  50.67 
 
 
390 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  50.26 
 
 
378 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  52.67 
 
 
378 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  46.93 
 
 
384 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  47.91 
 
 
378 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  45.31 
 
 
384 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  48.03 
 
 
376 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  45.31 
 
 
384 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  45.57 
 
 
384 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  46.28 
 
 
382 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  46.4 
 
 
382 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  49.87 
 
 
385 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  49.87 
 
 
390 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  44.92 
 
 
380 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  48.12 
 
 
385 aa  358  8e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  50.4 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  43.83 
 
 
388 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  49.87 
 
 
390 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  43.31 
 
 
387 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  45.62 
 
 
691 aa  301  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  42.78 
 
 
373 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  41.73 
 
 
373 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  42.18 
 
 
373 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  42.18 
 
 
373 aa  276  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  41.47 
 
 
373 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  41.47 
 
 
373 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  41.47 
 
 
373 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  41.91 
 
 
373 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  41.99 
 
 
375 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  39.41 
 
 
369 aa  272  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  41.21 
 
 
373 aa  272  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
367 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.9 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  38.61 
 
 
369 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  39.57 
 
 
371 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  43.05 
 
 
370 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 
382 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  35.37 
 
 
378 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  39.73 
 
 
366 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  35.11 
 
 
378 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  38.02 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  37.57 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  40.48 
 
 
366 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  39.14 
 
 
366 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  36.32 
 
 
379 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  36.97 
 
 
380 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  36.67 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  36.27 
 
 
376 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  35.48 
 
 
373 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  35.9 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  34.66 
 
 
369 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  33.16 
 
 
376 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 
366 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 
373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 
373 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 
376 aa  193  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  33.52 
 
 
375 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  31.73 
 
 
377 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 
405 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 
375 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
377 aa  186  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  31.75 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  33.05 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  31.12 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 
377 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  33.25 
 
 
376 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  35.4 
 
 
368 aa  179  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 
372 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
381 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
372 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  32.61 
 
 
387 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
383 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  31.03 
 
 
377 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  30.77 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  30.77 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
371 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
378 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 
383 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 
383 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 
368 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 
383 aa  171  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  30.03 
 
 
369 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  30.85 
 
 
377 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>