More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0112 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 372 aa  748    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  55.11 
 
 		 371 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  55.08 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  42.52 
 
 		 379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  43.68 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 377 aa  215  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  34.32 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  34.53 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  32.35 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  31.35 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  32.43 
 
 		 369 aa  186  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  34.04 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  32.07 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  27.25 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  29.04 
 
 		 378 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.4 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  28.4 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  28.4 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  28.4 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  28.4 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  28.4 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  28.4 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 373 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  27.79 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.22 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  28.26 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  29.19 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  27.25 
 
 		 383 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.49 
 
 		 380 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  28.13 
 
 		 371 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  28.19 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  28.19 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  28.19 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  28.19 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  28.19 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  31.15 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  28.22 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  28.61 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.14 
 
 		 382 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.92 
 
 		 369 aa  167  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  27.13 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.07 
 
 		 384 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  27.32 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  29.14 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  30.25 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  27.72 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 378 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  28.8 
 
 		 378 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  28.73 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.54 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  27.37 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>