More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4363 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 367 aa  729    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  90.44 
 
 		 371 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  86.58 
 
 		 366 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  74.73 
 
 		 369 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  68.85 
 
 		 365 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  69.61 
 
 		 366 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  70.41 
 
 		 366 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  61.56 
 
 		 373 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  62.1 
 
 		 373 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  62.37 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  62.37 
 
 		 373 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  62.37 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  62.1 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  61.29 
 
 		 373 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  61.29 
 
 		 373 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  61.02 
 
 		 373 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  62.83 
 
 		 381 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  59.14 
 
 		 375 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  57.7 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  59.25 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  49.05 
 
 		 370 aa  335  9e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  42.39 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  41.71 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  40.53 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  40.53 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  40.21 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40.53 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  42.7 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  40.26 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  41.58 
 
 		 378 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  42.2 
 
 		 384 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  41.3 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  42.25 
 
 		 374 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  40.63 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  38.95 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  41.58 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  42.37 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  41.83 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  39.57 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  39.3 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  44.41 
 
 		 378 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  38.58 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  39.1 
 
 		 380 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  38.89 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  42.37 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  37.3 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  43.16 
 
 		 368 aa  252  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  40.37 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 		 378 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 		 377 aa  242  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 		 376 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  38.42 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  38.83 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  39.04 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  35.64 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  37.11 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  37.94 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  37.63 
 
 		 691 aa  219  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  38.16 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  36.31 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  34.04 
 
 		 377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 		 405 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  35.03 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  34.43 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  32.71 
 
 		 377 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  34.93 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  32.98 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  32.71 
 
 		 378 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  34.21 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  31.12 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  35.23 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 377 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  33.43 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 377 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  35.6 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  33.15 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.89 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  31.59 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  33.83 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  33.79 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>