More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1046 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  100 
 
 
383 aa  763    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  35.17 
 
 
369 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  35.51 
 
 
377 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  36.55 
 
 
405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 
378 aa  222  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  33.86 
 
 
377 aa  222  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 
377 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 
377 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  32.99 
 
 
377 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  33.24 
 
 
373 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  32.73 
 
 
376 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  30.85 
 
 
378 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 
378 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 
380 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 
380 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 
377 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 
371 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  32.61 
 
 
371 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  30.89 
 
 
377 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  31.99 
 
 
376 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.43 
 
 
378 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.61 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  31.61 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  31.61 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  31.61 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  31.61 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  31.61 
 
 
377 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  31.99 
 
 
376 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  31.99 
 
 
376 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  31.99 
 
 
376 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  31.99 
 
 
376 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  31.61 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 
376 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  30.42 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  34.04 
 
 
380 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  30.55 
 
 
376 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  29.86 
 
 
382 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 
376 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  31.22 
 
 
376 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 
384 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  30.48 
 
 
375 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  30.71 
 
 
379 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  32.91 
 
 
427 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  31.12 
 
 
364 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 
391 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
391 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 
375 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 
368 aa  189  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  33.51 
 
 
369 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 
391 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  30.21 
 
 
379 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  30 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  30.55 
 
 
381 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  29.24 
 
 
382 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 
376 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 
379 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  30.1 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  30.35 
 
 
385 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
382 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 
375 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
367 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
375 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
376 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 
374 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 
388 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 
368 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
378 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 
376 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
377 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 
372 aa  176  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 
370 aa  176  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 
368 aa  176  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  29.46 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  31.21 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  29.97 
 
 
1106 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  30.73 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  29.66 
 
 
384 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  32.47 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 
366 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 
381 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
390 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  28.2 
 
 
380 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 
378 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 
373 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 
375 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 
384 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
384 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  30.79 
 
 
378 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
368 aa  169  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 
373 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>