More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1782 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  100 
 
 
364 aa  705    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  47.2 
 
 
376 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  45.6 
 
 
376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  44.15 
 
 
376 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  43.88 
 
 
376 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  41.98 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  44.27 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  43.13 
 
 
373 aa  298  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  42.18 
 
 
379 aa  298  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  43.88 
 
 
378 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  42.67 
 
 
377 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  43.88 
 
 
378 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  43.62 
 
 
376 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  43.47 
 
 
377 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  43.51 
 
 
405 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  43.32 
 
 
377 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  41.91 
 
 
376 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  43.55 
 
 
375 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  39.08 
 
 
369 aa  285  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  43.88 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 
380 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  42.31 
 
 
370 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 
370 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  40.58 
 
 
376 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  44.27 
 
 
376 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  40.48 
 
 
377 aa  266  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  39.9 
 
 
377 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  37.47 
 
 
366 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  41.6 
 
 
383 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  40.97 
 
 
383 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  38.93 
 
 
378 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  46.13 
 
 
376 aa  259  7e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  41.33 
 
 
383 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  36.31 
 
 
369 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  43.53 
 
 
381 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  39.89 
 
 
369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  39.89 
 
 
369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  38.01 
 
 
370 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  37.57 
 
 
379 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  41.24 
 
 
377 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  37.94 
 
 
369 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  40.29 
 
 
377 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  40.05 
 
 
369 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  35.41 
 
 
376 aa  249  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  38.84 
 
 
369 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  38.48 
 
 
370 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 
368 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  38.19 
 
 
370 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
378 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  38.42 
 
 
378 aa  243  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  35.6 
 
 
368 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  35.99 
 
 
371 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  38.86 
 
 
371 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 
371 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  34.89 
 
 
369 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 
369 aa  236  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 
368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 
368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 
373 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  34.92 
 
 
366 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  38.53 
 
 
370 aa  233  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  35.44 
 
 
375 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  36.78 
 
 
368 aa  233  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  35.2 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 
373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 
372 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  37.9 
 
 
371 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 
371 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  36.2 
 
 
435 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  36.81 
 
 
372 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  37.53 
 
 
372 aa  228  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  38.25 
 
 
372 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  38.07 
 
 
427 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  34.24 
 
 
378 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  37.85 
 
 
391 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 
371 aa  225  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  37.98 
 
 
391 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  38.08 
 
 
365 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 
378 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  32.43 
 
 
374 aa  222  9e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.8 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  33.8 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  33.8 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  33.8 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  33.8 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  33.8 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  33.8 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  37.16 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  35.57 
 
 
369 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
391 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 
377 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  32.68 
 
 
356 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  36.41 
 
 
375 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 
375 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 
384 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  37.57 
 
 
376 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  37.57 
 
 
376 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>