More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1379 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  100 
 
 
370 aa  736    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  44.59 
 
 
372 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  45.13 
 
 
369 aa  328  9e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  45.36 
 
 
369 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  45.36 
 
 
369 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  41.87 
 
 
371 aa  322  5e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  41.89 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  43.65 
 
 
370 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  43.58 
 
 
371 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  44.8 
 
 
369 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  42.7 
 
 
369 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  42.13 
 
 
368 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  44.28 
 
 
369 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  43.98 
 
 
370 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  41.04 
 
 
374 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  43.07 
 
 
370 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  40.18 
 
 
356 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  39.55 
 
 
435 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  38.25 
 
 
371 aa  269  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 
368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  36.81 
 
 
366 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  41.03 
 
 
372 aa  263  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  40.74 
 
 
372 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.99 
 
 
368 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  35.99 
 
 
368 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  35.99 
 
 
368 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  35.99 
 
 
368 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  35.99 
 
 
368 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  35.99 
 
 
368 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  35.99 
 
 
368 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  35.99 
 
 
368 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  37.17 
 
 
377 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  40.46 
 
 
372 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 
368 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
368 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  36.01 
 
 
368 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  35.91 
 
 
368 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  35.91 
 
 
368 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  35.87 
 
 
368 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  35.91 
 
 
368 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  35.91 
 
 
368 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  39.14 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 
376 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  40.48 
 
 
370 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 
378 aa  252  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  37.27 
 
 
376 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  36.81 
 
 
373 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  35.48 
 
 
376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 
365 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  36.53 
 
 
376 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  37.67 
 
 
384 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  37.2 
 
 
370 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 
374 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  40.23 
 
 
374 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  37.2 
 
 
377 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  35.96 
 
 
376 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  36.03 
 
 
376 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  33.15 
 
 
375 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  35.19 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 
368 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  38.53 
 
 
364 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
377 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  38.51 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  36.23 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
376 aa  212  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  35.65 
 
 
377 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  34.32 
 
 
352 aa  210  3e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
376 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  35.92 
 
 
377 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  29.97 
 
 
369 aa  199  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  32.16 
 
 
381 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
369 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
377 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  30.79 
 
 
370 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  32.85 
 
 
379 aa  190  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 
388 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 
380 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 
379 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 
427 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  35.29 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 
387 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  30.25 
 
 
378 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 
378 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.28 
 
 
378 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
383 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  31.54 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
368 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.11 
 
 
376 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  31.07 
 
 
383 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  30.62 
 
 
379 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>