More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2449 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  100 
 
 
369 aa  731    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  72.55 
 
 
369 aa  524  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  46.13 
 
 
379 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  44.24 
 
 
380 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  44.8 
 
 
376 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  44.8 
 
 
376 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  42.16 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  41.69 
 
 
370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 
387 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  41.38 
 
 
388 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40 
 
 
384 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  43.75 
 
 
369 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  41.22 
 
 
376 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  39.46 
 
 
380 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  42.93 
 
 
381 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 
384 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  42.7 
 
 
367 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.69 
 
 
365 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  39.3 
 
 
378 aa  289  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 
366 aa  288  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  42.7 
 
 
378 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  41.35 
 
 
390 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  41.92 
 
 
374 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  42.36 
 
 
390 aa  285  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  42.78 
 
 
375 aa  285  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  41.4 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  40.21 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  41.21 
 
 
382 aa  282  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  40.64 
 
 
377 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  42.7 
 
 
378 aa  281  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  38.44 
 
 
378 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  40.81 
 
 
379 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  41.78 
 
 
366 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  43.36 
 
 
378 aa  279  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  42.02 
 
 
366 aa  279  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  41.33 
 
 
373 aa  279  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  41.8 
 
 
369 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  41.07 
 
 
373 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  41.07 
 
 
373 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  41.07 
 
 
373 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  41.07 
 
 
373 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  39.08 
 
 
384 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  41.26 
 
 
385 aa  275  7e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  38.24 
 
 
377 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 
370 aa  275  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  41.78 
 
 
373 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  40.85 
 
 
373 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  40.85 
 
 
373 aa  272  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  40.32 
 
 
373 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  41.58 
 
 
368 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  40.58 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  38.67 
 
 
378 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  39.73 
 
 
390 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  38.13 
 
 
377 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  37.27 
 
 
375 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  37.33 
 
 
376 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  38.67 
 
 
376 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  40.9 
 
 
380 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  40.27 
 
 
390 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 
377 aa  257  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  37.87 
 
 
376 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  38.86 
 
 
385 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  39.84 
 
 
369 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  38.13 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  38.62 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  35.39 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  37.98 
 
 
382 aa  252  9.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 
373 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
377 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  38.67 
 
 
377 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  36.36 
 
 
376 aa  249  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 
373 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  36 
 
 
378 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 
378 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  36.56 
 
 
377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 
377 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 
371 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 
364 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 
379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 
366 aa  235  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  35.92 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  37.47 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  36.31 
 
 
691 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  35.92 
 
 
376 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  34.88 
 
 
368 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  36.54 
 
 
427 aa  225  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 
368 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  34.22 
 
 
378 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  33.96 
 
 
378 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  35.04 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 
370 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  33.33 
 
 
376 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  33.33 
 
 
376 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  33.33 
 
 
376 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
391 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  33.33 
 
 
376 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>