More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2907 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  100 
 
 
376 aa  753    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  67.55 
 
 
375 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  64.63 
 
 
376 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  63.3 
 
 
376 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  62.77 
 
 
376 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  61.7 
 
 
376 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  53.19 
 
 
376 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  51.99 
 
 
373 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  52.93 
 
 
376 aa  339  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  42.3 
 
 
377 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  42.4 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  41.38 
 
 
378 aa  299  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  41.87 
 
 
378 aa  285  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  39 
 
 
435 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  42.67 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  40 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  41.07 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  40.74 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  40.27 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  39.95 
 
 
377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  37.89 
 
 
370 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  38.17 
 
 
370 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  39.95 
 
 
378 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
376 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  38.56 
 
 
368 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  36.56 
 
 
372 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  37.57 
 
 
370 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  36.06 
 
 
369 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  43.47 
 
 
369 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  38.62 
 
 
369 aa  256  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  39.2 
 
 
377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  38.77 
 
 
376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  37.97 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  38.87 
 
 
380 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  37.47 
 
 
366 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  37 
 
 
369 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 
372 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  39.13 
 
 
372 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  37.57 
 
 
370 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  37.84 
 
 
383 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 
383 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  37 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  37.25 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  38.04 
 
 
372 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  44.3 
 
 
364 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  37.33 
 
 
369 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  37.33 
 
 
369 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 
368 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
365 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  36.39 
 
 
377 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  34.49 
 
 
374 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  34.95 
 
 
371 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  35.66 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  32.98 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  35.36 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  37.78 
 
 
374 aa  232  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  37.96 
 
 
381 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  37 
 
 
382 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
368 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  34.25 
 
 
356 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 
368 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  36.1 
 
 
376 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  33.24 
 
 
369 aa  226  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
371 aa  226  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
378 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 
379 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
368 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 
368 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  35.16 
 
 
375 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
378 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 
368 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  32.73 
 
 
383 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 
390 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.38 
 
 
368 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 
368 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  31.38 
 
 
368 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 
378 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  31.38 
 
 
368 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 
368 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  31.38 
 
 
368 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
371 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  31.38 
 
 
368 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  31.38 
 
 
368 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 
427 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 
371 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  35.2 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  31.12 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  30.85 
 
 
368 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  30.85 
 
 
368 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>