More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1106 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  100 
 
 
379 aa  764    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  65.08 
 
 
373 aa  461  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  45.41 
 
 
371 aa  328  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 
372 aa  308  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  42.52 
 
 
372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 
377 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  36.36 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 
376 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  35.85 
 
 
376 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 
375 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  37.43 
 
 
376 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 
376 aa  225  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  34.76 
 
 
376 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  35.22 
 
 
376 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  39.57 
 
 
376 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 
370 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 
369 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  33.15 
 
 
378 aa  203  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 
383 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  32.45 
 
 
369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 
376 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  31.9 
 
 
377 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  31.54 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  35.37 
 
 
377 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 
405 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  31.9 
 
 
371 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  32.88 
 
 
376 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 
376 aa  192  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 
379 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  31.89 
 
 
365 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 
366 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30.25 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  30.25 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  30.25 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  30.25 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  30.25 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  30.25 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  30.25 
 
 
368 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  30.25 
 
 
368 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  30.25 
 
 
368 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  30.25 
 
 
368 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  30.25 
 
 
368 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  29.18 
 
 
369 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 
372 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 
369 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  31.77 
 
 
377 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  34.86 
 
 
369 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  30.61 
 
 
368 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 
368 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 
370 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  28 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  31.52 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 
370 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 
368 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 
370 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 
369 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 
368 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  31 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  30.46 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 
368 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  29.18 
 
 
378 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  29.81 
 
 
382 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.71 
 
 
378 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 
378 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 
380 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  33.99 
 
 
364 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  31.52 
 
 
356 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  29.73 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
368 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 
368 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
368 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
371 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  31.18 
 
 
371 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 
371 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  30.63 
 
 
376 aa  169  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  30.68 
 
 
385 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 
374 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 
368 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 
371 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
375 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.03 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  30 
 
 
375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 
375 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
388 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.44 
 
 
376 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.92 
 
 
376 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>