More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0132 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  100 
 
 
370 aa  731    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  73.24 
 
 
370 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  74.73 
 
 
369 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  74.05 
 
 
370 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  67.85 
 
 
371 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  50.27 
 
 
374 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  49.58 
 
 
356 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  51.22 
 
 
372 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  50.95 
 
 
372 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  50.95 
 
 
372 aa  347  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  45.68 
 
 
370 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  47.67 
 
 
368 aa  335  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  46.3 
 
 
368 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  46.3 
 
 
368 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  49.45 
 
 
368 aa  332  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  49.46 
 
 
374 aa  328  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  45.28 
 
 
384 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  45.99 
 
 
378 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  45.45 
 
 
378 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  45.23 
 
 
368 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  46.45 
 
 
369 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  46.45 
 
 
369 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  47.14 
 
 
369 aa  319  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  44.14 
 
 
366 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  44.66 
 
 
368 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  44.66 
 
 
368 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  44.66 
 
 
368 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  44.66 
 
 
368 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  44.66 
 
 
368 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  44.66 
 
 
368 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  44.66 
 
 
368 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  44.66 
 
 
368 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  44.11 
 
 
368 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  44.11 
 
 
368 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  44.11 
 
 
368 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  44.11 
 
 
368 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  44.11 
 
 
368 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  44.51 
 
 
368 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  43.29 
 
 
368 aa  309  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  43.56 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
365 aa  293  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  41.64 
 
 
369 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  41.27 
 
 
435 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  42.19 
 
 
370 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 
371 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  42.08 
 
 
352 aa  280  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 
371 aa  278  7e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  41.64 
 
 
376 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  42.01 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  42.43 
 
 
374 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  39.52 
 
 
376 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  39.73 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  38.01 
 
 
376 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  39.3 
 
 
376 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  37.1 
 
 
376 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  38.9 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 
376 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  40.48 
 
 
370 aa  241  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  41.35 
 
 
376 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  37.39 
 
 
377 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  35.31 
 
 
375 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  39.66 
 
 
378 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  35.01 
 
 
377 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  37.23 
 
 
377 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 
383 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 
383 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  37.03 
 
 
383 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  36.17 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
376 aa  210  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 
377 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  32.79 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  33.25 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  34.05 
 
 
376 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  37.28 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 
378 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  32.19 
 
 
379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  33.15 
 
 
369 aa  190  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 
377 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 
377 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 
379 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.47 
 
 
378 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  32.01 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  35 
 
 
369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 
369 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0896  ABC-2 type transporter  35.85 
 
 
382 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  35.01 
 
 
391 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  35.01 
 
 
379 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  33.43 
 
 
368 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  35.01 
 
 
387 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  32.84 
 
 
366 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  34.7 
 
 
375 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 
391 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>