More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0811 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  100 
 
 
377 aa  766    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  45.84 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  39.95 
 
 
376 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  41.76 
 
 
376 aa  292  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  39.29 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  39.57 
 
 
377 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  41.04 
 
 
373 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 
379 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  36.83 
 
 
376 aa  269  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  39.78 
 
 
376 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 
376 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  42.67 
 
 
364 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  38.99 
 
 
378 aa  259  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  36.53 
 
 
376 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  36.7 
 
 
379 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  41.21 
 
 
369 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  37.97 
 
 
376 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  39.57 
 
 
376 aa  249  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  35.49 
 
 
376 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  37.53 
 
 
383 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  37.26 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 
368 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  37.26 
 
 
383 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 
368 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  36.17 
 
 
366 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  35.34 
 
 
369 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 
381 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  37.04 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
370 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  34.74 
 
 
377 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  37.67 
 
 
371 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  35.22 
 
 
365 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  34.14 
 
 
375 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 
369 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.8 
 
 
368 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 
368 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  32.8 
 
 
368 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  32.8 
 
 
368 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  32.8 
 
 
368 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  32.8 
 
 
368 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  32.8 
 
 
368 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 
368 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  35.28 
 
 
378 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 
369 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  33.24 
 
 
368 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  33.15 
 
 
368 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 
368 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  36.39 
 
 
371 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  32.98 
 
 
368 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  32.98 
 
 
368 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  32.98 
 
 
368 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  32.98 
 
 
368 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 
380 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 
368 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 
376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  35.26 
 
 
378 aa  222  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 
368 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  34.59 
 
 
371 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  35.03 
 
 
370 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  32.89 
 
 
369 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 
368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
372 aa  215  8e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  34.08 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  36.46 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  34.95 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  33.52 
 
 
377 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 
379 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  31.85 
 
 
377 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  36.27 
 
 
369 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  36.27 
 
 
369 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
372 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
369 aa  209  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  34.91 
 
 
375 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  31.82 
 
 
376 aa  209  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 
370 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 
378 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
378 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 
375 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
374 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 
373 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 
390 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 
378 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 
427 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  33.24 
 
 
369 aa  202  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  31.18 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  31.48 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  34.32 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.350445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>