More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5641 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  100 
 
 
372 aa  748    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  60.22 
 
 
371 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  55.08 
 
 
372 aa  433  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 
379 aa  332  7.000000000000001e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  44.51 
 
 
373 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  32.9 
 
 
377 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  34.06 
 
 
373 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
376 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  34.14 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
376 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 
376 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  32.15 
 
 
370 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  32.15 
 
 
370 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.16 
 
 
368 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  31.16 
 
 
368 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 
368 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 
368 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  31.16 
 
 
368 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  30.99 
 
 
368 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  31.16 
 
 
368 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  31.16 
 
 
368 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  31.16 
 
 
368 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 
368 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  30.22 
 
 
368 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 
370 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 
369 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  30.22 
 
 
368 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  30.22 
 
 
368 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  30.22 
 
 
368 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  30.22 
 
 
368 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  30 
 
 
366 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
368 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 
375 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
368 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  32.7 
 
 
376 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 
368 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  32.19 
 
 
376 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 
376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  32.44 
 
 
377 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  33.15 
 
 
369 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  34.06 
 
 
369 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  30.45 
 
 
369 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 
371 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.61 
 
 
378 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  31.62 
 
 
371 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 
374 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  32.53 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.97 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
383 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 
364 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 
372 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
383 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  31.18 
 
 
376 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 
370 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  28.03 
 
 
382 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29.16 
 
 
384 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  29.97 
 
 
368 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  29.44 
 
 
383 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 
384 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 
376 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  32.65 
 
 
379 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  26.92 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  30.64 
 
 
371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 
368 aa  166  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  28.57 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  30.41 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  28.42 
 
 
377 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
377 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.44 
 
 
376 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  30.47 
 
 
365 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.52 
 
 
384 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
366 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  29.14 
 
 
374 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 
379 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
376 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
371 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  30.6 
 
 
371 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 
369 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 
377 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
369 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  30.95 
 
 
369 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
378 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
378 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.64 
 
 
381 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  27.87 
 
 
382 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  30.32 
 
 
369 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  30.52 
 
 
371 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  25.66 
 
 
374 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  30.79 
 
 
382 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 
390 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.17 
 
 
380 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 
377 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  25.37 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0896  ABC-2 type transporter  32.75 
 
 
382 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>