More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0698 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  100 
 
 
376 aa  750    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  59.36 
 
 
374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  56.12 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  55.32 
 
 
384 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  54.09 
 
 
381 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  54.79 
 
 
384 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  53.52 
 
 
388 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  53.4 
 
 
387 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  57.98 
 
 
378 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  55.32 
 
 
379 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  55.85 
 
 
378 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  52.01 
 
 
380 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  56.84 
 
 
378 aa  411  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  52.94 
 
 
384 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  53.21 
 
 
382 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  54.09 
 
 
390 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  48.8 
 
 
378 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  50.67 
 
 
390 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  50.27 
 
 
385 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  50 
 
 
390 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  50.94 
 
 
385 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  50.27 
 
 
378 aa  362  6e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  52.15 
 
 
368 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  50.94 
 
 
371 aa  359  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  50 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  48.95 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  48.01 
 
 
382 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 
377 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  48.03 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  45.38 
 
 
691 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  40.11 
 
 
378 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  39.84 
 
 
378 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  41.55 
 
 
371 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  41.22 
 
 
369 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.78 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  40.21 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  41.33 
 
 
373 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  40.64 
 
 
373 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  40.64 
 
 
373 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  40.64 
 
 
373 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  40.64 
 
 
373 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  40.37 
 
 
373 aa  276  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  40.85 
 
 
375 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 
373 aa  275  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 
373 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  42.9 
 
 
366 aa  272  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  40.53 
 
 
373 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  38.24 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  39.42 
 
 
369 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  37.57 
 
 
369 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  39.41 
 
 
366 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 
382 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  42.02 
 
 
370 aa  259  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  38.99 
 
 
366 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 
380 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  36.03 
 
 
379 aa  240  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  36.6 
 
 
369 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 
376 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  35.51 
 
 
376 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  35.53 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 
405 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  36.1 
 
 
376 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  36.27 
 
 
370 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  35.85 
 
 
373 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  35.56 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  35.11 
 
 
376 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 
377 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  32.01 
 
 
377 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
376 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  32.53 
 
 
376 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 
366 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  32.81 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  35.21 
 
 
381 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
373 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
375 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  32.98 
 
 
377 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  30 
 
 
376 aa  199  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  31.99 
 
 
373 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  32.71 
 
 
375 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 
368 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
368 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 
376 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  32.3 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 
372 aa  190  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  31.93 
 
 
378 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 
379 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  36.11 
 
 
380 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 
377 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 
368 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 
377 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  34.95 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  34.95 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  33.07 
 
 
376 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  33.62 
 
 
387 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.72 
 
 
378 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 
364 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  32.07 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>