More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1512 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  100 
 
 
369 aa  725    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  48.16 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  43.92 
 
 
379 aa  322  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 
370 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  41.8 
 
 
369 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  40.98 
 
 
369 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  39.04 
 
 
376 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  38.5 
 
 
376 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  41.33 
 
 
378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 
366 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  36.6 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  39.29 
 
 
373 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  38.81 
 
 
376 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.7 
 
 
365 aa  255  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  37.98 
 
 
366 aa  252  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  37.16 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  37.67 
 
 
366 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 
390 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  37.33 
 
 
377 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  37.73 
 
 
405 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 
369 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  37.94 
 
 
367 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  37.17 
 
 
377 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  36.68 
 
 
385 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  39.45 
 
 
369 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  37.53 
 
 
377 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  36.6 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 
371 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  34.93 
 
 
379 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  36.17 
 
 
376 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  35.47 
 
 
380 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  37.17 
 
 
376 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  36.51 
 
 
390 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  33.68 
 
 
384 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  33.68 
 
 
384 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  32.62 
 
 
381 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  34.76 
 
 
373 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  34.76 
 
 
373 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  34.22 
 
 
384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  36.51 
 
 
374 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  37.6 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  36.41 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  34.46 
 
 
381 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  34.49 
 
 
373 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 
366 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
377 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  39.44 
 
 
364 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  35.11 
 
 
373 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  35.04 
 
 
385 aa  233  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  34.49 
 
 
373 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.89 
 
 
384 aa  232  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  33.16 
 
 
382 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  34.22 
 
 
377 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  35.31 
 
 
375 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 
387 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 
378 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 
390 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
377 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 
368 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  36.04 
 
 
378 aa  226  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  35.86 
 
 
381 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  34.95 
 
 
378 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  36.14 
 
 
390 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 
373 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  34.76 
 
 
375 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
377 aa  223  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  36 
 
 
377 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  35.47 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
376 aa  219  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 
373 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 
380 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 
368 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  35.22 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  34.66 
 
 
378 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  34.15 
 
 
376 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  35.79 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 
371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 
378 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 
379 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  33.16 
 
 
378 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  32.7 
 
 
375 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  35.77 
 
 
379 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  35.52 
 
 
376 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  34.14 
 
 
371 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  34.13 
 
 
376 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  34.13 
 
 
376 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
368 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  34.13 
 
 
376 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  34.14 
 
 
371 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>