More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1079 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  100 
 
 
375 aa  741    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  68.58 
 
 
368 aa  472  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  47.14 
 
 
368 aa  354  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  47.27 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  41.76 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  38.61 
 
 
366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  37.81 
 
 
373 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 
378 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  37.33 
 
 
377 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  35.79 
 
 
375 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  36.24 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  34.14 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  37.27 
 
 
377 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  35.62 
 
 
376 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 
370 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  35.6 
 
 
405 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 
376 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  38.06 
 
 
369 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  36.24 
 
 
376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  36.07 
 
 
376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  34.5 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
376 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 
376 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 
377 aa  216  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  35.04 
 
 
369 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  36.34 
 
 
380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  34.88 
 
 
381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 
376 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 
376 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  34.66 
 
 
379 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
369 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  32.79 
 
 
376 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  35.23 
 
 
373 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  34.52 
 
 
380 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  34.49 
 
 
369 aa  205  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  35.41 
 
 
390 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 
376 aa  203  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  35.44 
 
 
364 aa  203  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  36.12 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  35.04 
 
 
371 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 
378 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
371 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  33.16 
 
 
371 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  35.23 
 
 
367 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  34.3 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  34.38 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  32.15 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  32.71 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  33.24 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 
383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 
380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.24 
 
 
365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  33.06 
 
 
381 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 
380 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 
369 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  35.62 
 
 
385 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  33.69 
 
 
378 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  32.64 
 
 
383 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
388 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  30.98 
 
 
377 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.43 
 
 
378 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  32 
 
 
375 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
377 aa  193  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 
383 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 
383 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  32.11 
 
 
382 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 
379 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 
366 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 
391 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
368 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  34.71 
 
 
371 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  31.77 
 
 
384 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.68 
 
 
384 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  32.01 
 
 
384 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  35.73 
 
 
366 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  33.33 
 
 
382 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
377 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  34.16 
 
 
378 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 
370 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 
371 aa  187  3e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 
391 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
387 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 
378 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 
384 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 
368 aa  186  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  33.25 
 
 
373 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  33.24 
 
 
378 aa  186  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 
378 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  33.25 
 
 
373 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  33.25 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 
373 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  33.88 
 
 
366 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 
373 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>