More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1294 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
378 aa  759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  72.22 
 
 
378 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  69.5 
 
 
377 aa  524  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  54.23 
 
 
378 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  41.53 
 
 
377 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  43.12 
 
 
378 aa  309  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  41.42 
 
 
377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  45.36 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  41.71 
 
 
405 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  43.19 
 
 
377 aa  292  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  42.9 
 
 
377 aa  291  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  41.11 
 
 
377 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  41.67 
 
 
373 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  37.27 
 
 
376 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  38.16 
 
 
379 aa  258  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  40.26 
 
 
375 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  38.99 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  38.68 
 
 
371 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  38.68 
 
 
371 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  39.1 
 
 
378 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  40.35 
 
 
376 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  38.3 
 
 
391 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  39.63 
 
 
382 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  38.97 
 
 
376 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  38.97 
 
 
376 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  38.97 
 
 
376 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  38.97 
 
 
376 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  38.3 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  38.97 
 
 
376 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  36.32 
 
 
379 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  39.84 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  37.36 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  41.11 
 
 
374 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  38.68 
 
 
377 aa  242  9e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  36.72 
 
 
377 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.72 
 
 
377 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  36.72 
 
 
377 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  36.72 
 
 
377 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  36.72 
 
 
377 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  40.05 
 
 
427 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  36.72 
 
 
377 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  36.72 
 
 
377 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  36.72 
 
 
377 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  40.84 
 
 
387 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  36.72 
 
 
377 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  34.58 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  37 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
364 aa  240  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 
384 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  40.31 
 
 
389 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  37.2 
 
 
373 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  37.43 
 
 
375 aa  235  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  35.53 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  36.68 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  35.64 
 
 
391 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  39.9 
 
 
389 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  40.31 
 
 
389 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 
376 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  37.83 
 
 
375 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  33.78 
 
 
376 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  38.08 
 
 
384 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  36.81 
 
 
379 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 
376 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  36.34 
 
 
376 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  34.55 
 
 
357 aa  226  7e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  38.56 
 
 
1171 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  37.14 
 
 
381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  39.63 
 
 
377 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  34.49 
 
 
366 aa  223  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  38.38 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  40.17 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  34.76 
 
 
370 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  35.47 
 
 
376 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  36.24 
 
 
378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
383 aa  213  5.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  32.62 
 
 
375 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  37.5 
 
 
380 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 
368 aa  210  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  34.22 
 
 
387 aa  209  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  33.82 
 
 
368 aa  208  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  32.54 
 
 
377 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  32.44 
 
 
369 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  35.28 
 
 
1106 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 
370 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 
377 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  35.28 
 
 
380 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  35.28 
 
 
380 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  36.49 
 
 
381 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  34.22 
 
 
376 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  37.17 
 
 
377 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 
372 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 
369 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  34.99 
 
 
380 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  33.7 
 
 
369 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
380 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 
376 aa  195  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  36.34 
 
 
376 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>