More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2156 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  100 
 
 
1106 aa  2178    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  53.29 
 
 
1171 aa  1053    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  56.33 
 
 
599 aa  611  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  52.66 
 
 
593 aa  592  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  54.59 
 
 
592 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 
592 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  51.69 
 
 
588 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
583 aa  551  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  49.92 
 
 
593 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  48.63 
 
 
587 aa  548  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  47.34 
 
 
589 aa  538  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  48.85 
 
 
599 aa  535  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  50 
 
 
585 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  50.08 
 
 
579 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  45.09 
 
 
575 aa  513  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 
576 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  44.04 
 
 
580 aa  506  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  48.89 
 
 
578 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.22 
 
 
578 aa  502  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  45.22 
 
 
578 aa  502  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  43.71 
 
 
580 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
578 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  45.22 
 
 
578 aa  502  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
578 aa  503  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
578 aa  502  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 
578 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  46.21 
 
 
579 aa  503  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  50.09 
 
 
581 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  45.75 
 
 
582 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  45.22 
 
 
578 aa  502  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
578 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  47.16 
 
 
582 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  48.98 
 
 
576 aa  495  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
585 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  45.9 
 
 
580 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
580 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  46.69 
 
 
590 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 
578 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
578 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
578 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 
578 aa  486  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  43.63 
 
 
580 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  44.43 
 
 
578 aa  486  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  45.99 
 
 
594 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  46.03 
 
 
590 aa  482  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  42.71 
 
 
583 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  48.07 
 
 
580 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  43.55 
 
 
617 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 
551 aa  411  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 
541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  51.65 
 
 
371 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  51.65 
 
 
371 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  38.08 
 
 
651 aa  389  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  53.94 
 
 
374 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  52.55 
 
 
387 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  49.49 
 
 
385 aa  359  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.74 
 
 
907 aa  352  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  34.78 
 
 
901 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  45.92 
 
 
382 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  34.83 
 
 
901 aa  346  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  34.83 
 
 
901 aa  344  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  32.8 
 
 
912 aa  337  9e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  33.19 
 
 
914 aa  336  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  32.67 
 
 
912 aa  332  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  32.06 
 
 
933 aa  330  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  32.72 
 
 
912 aa  330  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  32.12 
 
 
920 aa  327  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  31.57 
 
 
921 aa  327  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  32.72 
 
 
929 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  31.59 
 
 
911 aa  325  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  31.59 
 
 
911 aa  325  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  31.59 
 
 
911 aa  325  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  31.59 
 
 
911 aa  325  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  31.59 
 
 
911 aa  324  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  32.23 
 
 
916 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  31.27 
 
 
911 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  31.45 
 
 
911 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  31.45 
 
 
911 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  32.86 
 
 
943 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  31.45 
 
 
911 aa  323  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  32.49 
 
 
916 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  34 
 
 
901 aa  322  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  31.54 
 
 
913 aa  322  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  33.43 
 
 
936 aa  322  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  33.43 
 
 
936 aa  322  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  31.86 
 
 
913 aa  322  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  32.73 
 
 
927 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  34.06 
 
 
916 aa  321  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  31.68 
 
 
917 aa  320  9e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  31 
 
 
926 aa  320  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  31.4 
 
 
913 aa  320  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
930 aa  319  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  31.4 
 
 
913 aa  319  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  31.64 
 
 
922 aa  318  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  32.93 
 
 
1017 aa  317  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  30.91 
 
 
927 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  33.57 
 
 
994 aa  316  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  31.85 
 
 
928 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  42.71 
 
 
376 aa  314  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  42.71 
 
 
376 aa  314  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>