More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3038 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  100 
 
 		 588 aa  1191    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  56.86 
 
 		 593 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  58.04 
 
 		 593 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  56.07 
 
 		 599 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  51.96 
 
 		 589 aa  596  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 583 aa  594  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  55.81 
 
 		 578 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  52.87 
 
 		 599 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  49.13 
 
 		 587 aa  547  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  50.34 
 
 		 592 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  50.34 
 
 		 592 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  51.69 
 
 		 1106 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  47.8 
 
 		 576 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  48.3 
 
 		 575 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  47.49 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 580 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  46.31 
 
 		 580 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.49 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  48.01 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  47.74 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  48.01 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  47.31 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  48.19 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  48.01 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  47.49 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  47.31 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  48.01 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  49.29 
 
 		 582 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  49.91 
 
 		 585 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  50.36 
 
 		 581 aa  515  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  46.99 
 
 		 579 aa  511  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  46.74 
 
 		 580 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  47.38 
 
 		 590 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 585 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  46.67 
 
 		 590 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  48.17 
 
 		 583 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  46.78 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  46.84 
 
 		 578 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  48.84 
 
 		 576 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  48.54 
 
 		 579 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  44.62 
 
 		 580 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  48.38 
 
 		 580 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  49.37 
 
 		 582 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  44.44 
 
 		 580 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  43.89 
 
 		 617 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 551 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  39.08 
 
 		 651 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  42.21 
 
 		 512 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  41.49 
 
 		 510 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  38.8 
 
 		 932 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  36.47 
 
 		 667 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  38.16 
 
 		 920 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  38.82 
 
 		 922 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  40.76 
 
 		 901 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  38.56 
 
 		 933 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  37.39 
 
 		 925 aa  350  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  39.82 
 
 		 901 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  39.82 
 
 		 901 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  38.7 
 
 		 912 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  37.95 
 
 		 943 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  37.7 
 
 		 917 aa  347  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  38.84 
 
 		 916 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  38.63 
 
 		 924 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  38.11 
 
 		 906 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  38.52 
 
 		 906 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  37.5 
 
 		 921 aa  343  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  37.25 
 
 		 936 aa  343  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  37.28 
 
 		 918 aa  343  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  37.25 
 
 		 936 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  38.34 
 
 		 912 aa  340  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.22 
 
 		 906 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  36.59 
 
 		 911 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  38.49 
 
 		 927 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  36.41 
 
 		 913 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  36.23 
 
 		 913 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  36.23 
 
 		 913 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  36.05 
 
 		 913 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  37.32 
 
 		 914 aa  332  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  37.39 
 
 		 928 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  37.48 
 
 		 930 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.14 
 
 		 916 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  38.25 
 
 		 994 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  36.41 
 
 		 916 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  37.02 
 
 		 1017 aa  326  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  36.35 
 
 		 918 aa  327  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  37.52 
 
 		 904 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  36.12 
 
 		 930 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  35.68 
 
 		 935 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  36.17 
 
 		 919 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  34.81 
 
 		 927 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  34.54 
 
 		 922 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.17 
 
 		 1082 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.17 
 
 		 1071 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.17 
 
 		 1071 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  36.17 
 
 		 1066 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.17 
 
 		 1079 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>