More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1740 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  58.94 
 
 		 583 aa  697    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  71.03 
 
 		 593 aa  791    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 589 aa  710    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  66.28 
 
 		 599 aa  770    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  100 
 
 		 593 aa  1183    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  56.86 
 
 		 588 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  56.28 
 
 		 599 aa  589  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  51.53 
 
 		 587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  57.83 
 
 		 578 aa  570  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  52.35 
 
 		 1106 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  48.9 
 
 		 583 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  49.05 
 
 		 579 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  52.43 
 
 		 592 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  52.43 
 
 		 592 aa  543  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  50.26 
 
 		 582 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 		 578 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.55 
 
 		 578 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  48.55 
 
 		 578 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 580 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  48.38 
 
 		 578 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  48.5 
 
 		 580 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  48.55 
 
 		 578 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 		 578 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  48.55 
 
 		 578 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 		 578 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 578 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  47.57 
 
 		 578 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  47.57 
 
 		 578 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  47.57 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  47.57 
 
 		 578 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  51.06 
 
 		 581 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 		 576 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  47.92 
 
 		 585 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  50.88 
 
 		 585 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  49.91 
 
 		 576 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  48.81 
 
 		 582 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  47.98 
 
 		 578 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  47.66 
 
 		 580 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  46.08 
 
 		 575 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  48.39 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  50.36 
 
 		 579 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  47.26 
 
 		 590 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  42.55 
 
 		 580 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  42.6 
 
 		 580 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  47.27 
 
 		 590 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  49.31 
 
 		 580 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  45.51 
 
 		 617 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  41.5 
 
 		 651 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  43.09 
 
 		 512 aa  425  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 551 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  41.16 
 
 		 906 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  43.56 
 
 		 901 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  41.33 
 
 		 917 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.48 
 
 		 906 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  41.64 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  43.56 
 
 		 901 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  41.16 
 
 		 906 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 541 aa  389  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  40.35 
 
 		 921 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  41.36 
 
 		 912 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.72 
 
 		 667 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  40.7 
 
 		 933 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  42.27 
 
 		 901 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  42.62 
 
 		 916 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  40.86 
 
 		 942 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  39.9 
 
 		 918 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  39.43 
 
 		 916 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  39.51 
 
 		 914 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  39.12 
 
 		 929 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  39.3 
 
 		 927 aa  343  7e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  38.64 
 
 		 927 aa  343  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  38.21 
 
 		 922 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  53.71 
 
 		 1171 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  54.84 
 
 		 333 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 312 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  45.7 
 
 		 943 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  43.87 
 
 		 270 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  49.77 
 
 		 248 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  56.36 
 
 		 322 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  52.73 
 
 		 325 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  48.66 
 
 		 324 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  56.22 
 
 		 322 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  56.94 
 
 		 322 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  46.38 
 
 		 312 aa  237  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  46.34 
 
 		 247 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 		 320 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  48.99 
 
 		 257 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  50.45 
 
 		 319 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  52.27 
 
 		 322 aa  234  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  44.77 
 
 		 932 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 317 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  45.12 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  49.08 
 
 		 255 aa  230  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  41.88 
 
 		 314 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  49.13 
 
 		 319 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 921 aa  229  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  54.42 
 
 		 314 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  49.77 
 
 		 319 aa  229  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  43.77 
 
 		 311 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>