More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3307 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  100 
 
 
322 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  99.38 
 
 
322 aa  624  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  97.4 
 
 
322 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  73.95 
 
 
314 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  56.44 
 
 
325 aa  322  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  56.81 
 
 
322 aa  315  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  55.26 
 
 
312 aa  311  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  48.38 
 
 
324 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  49.04 
 
 
320 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  49.52 
 
 
319 aa  289  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  51.16 
 
 
319 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  49.04 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  50.78 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  49.83 
 
 
319 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  56.76 
 
 
247 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 
308 aa  272  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  54.75 
 
 
248 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  58.11 
 
 
257 aa  269  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  57.2 
 
 
510 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  57.59 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  47.39 
 
 
651 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  43.38 
 
 
311 aa  263  3e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  53.6 
 
 
270 aa  263  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 
314 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  55.65 
 
 
512 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  58.41 
 
 
593 aa  255  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  43.85 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  56.19 
 
 
582 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  47.87 
 
 
350 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  46.98 
 
 
316 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
309 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  52.74 
 
 
590 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  55.26 
 
 
578 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  53.95 
 
 
581 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  53.54 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  52.7 
 
 
580 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  52.7 
 
 
580 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  52.38 
 
 
575 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  52.4 
 
 
590 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  44.98 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  56.36 
 
 
593 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  51.57 
 
 
599 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  55.71 
 
 
594 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  44.16 
 
 
312 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  56.95 
 
 
1106 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 
305 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  52.23 
 
 
912 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  54.05 
 
 
585 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
578 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  52.73 
 
 
578 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
578 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  52.73 
 
 
578 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
578 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  52.73 
 
 
578 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  52.73 
 
 
578 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  53.15 
 
 
580 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
578 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
578 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
578 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
578 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
578 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  52.73 
 
 
579 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
578 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  54.34 
 
 
576 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  51.3 
 
 
579 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  44.37 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
578 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  51.09 
 
 
599 aa  235  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  43.32 
 
 
307 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  43.09 
 
 
308 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  53.27 
 
 
589 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  40 
 
 
335 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
583 aa  232  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  51.57 
 
 
576 aa  232  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  44.69 
 
 
315 aa  231  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  41.99 
 
 
314 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  47.96 
 
 
255 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  49.12 
 
 
580 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  51.82 
 
 
582 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
580 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  41.21 
 
 
313 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  51.83 
 
 
583 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  40.51 
 
 
315 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  40.13 
 
 
323 aa  229  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  52.25 
 
 
904 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  54.55 
 
 
1171 aa  228  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  42.68 
 
 
667 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  50.23 
 
 
323 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  48.46 
 
 
299 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  56.22 
 
 
578 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.62 
 
 
308 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  51.53 
 
 
585 aa  225  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  51.14 
 
 
933 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  41.96 
 
 
323 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  51.09 
 
 
580 aa  225  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.66 
 
 
308 aa  225  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  51.77 
 
 
592 aa  225  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  40.63 
 
 
318 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  42.09 
 
 
323 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>