More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5639 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  74.49 
 
 
247 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  73.14 
 
 
270 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  66.39 
 
 
275 aa  340  9e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  63.11 
 
 
255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  57.27 
 
 
314 aa  288  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  55.17 
 
 
320 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  52.5 
 
 
324 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  53.71 
 
 
312 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  51.68 
 
 
257 aa  276  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  56.22 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  54.71 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  54.71 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  51.12 
 
 
322 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  52.97 
 
 
512 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  54.75 
 
 
322 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  53.02 
 
 
510 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  55.3 
 
 
322 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  55.3 
 
 
322 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  51.34 
 
 
325 aa  267  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  49.59 
 
 
594 aa  263  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  49.78 
 
 
319 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  53.12 
 
 
333 aa  257  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  51.34 
 
 
308 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 
576 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  48.55 
 
 
578 aa  249  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  48.55 
 
 
578 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
578 aa  249  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 
309 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
578 aa  249  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.55 
 
 
578 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  47.62 
 
 
583 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  49.79 
 
 
311 aa  249  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  48.55 
 
 
578 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
578 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  50 
 
 
582 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
578 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
578 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  46.56 
 
 
590 aa  248  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  50 
 
 
593 aa  248  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  45.75 
 
 
590 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  48.55 
 
 
589 aa  248  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  48.89 
 
 
316 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 
578 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
583 aa  248  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 
578 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  46.72 
 
 
580 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  46.72 
 
 
580 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  49.35 
 
 
578 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 
578 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  46.49 
 
 
575 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  48.44 
 
 
255 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 
578 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  50.92 
 
 
578 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  46.98 
 
 
307 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  46.28 
 
 
585 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  47.3 
 
 
580 aa  244  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
580 aa  244  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  45.75 
 
 
582 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
579 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  46.89 
 
 
576 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  44.4 
 
 
581 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  49.77 
 
 
593 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  49.57 
 
 
599 aa  241  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  46.89 
 
 
585 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  44.77 
 
 
578 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  49.32 
 
 
579 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  49.32 
 
 
580 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  48.37 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  43.27 
 
 
318 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  46.06 
 
 
580 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  46.29 
 
 
651 aa  235  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  45.29 
 
 
323 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  47.19 
 
 
920 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  45.29 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  45.53 
 
 
922 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  48.71 
 
 
551 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  45.73 
 
 
912 aa  231  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  46.64 
 
 
304 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  48.83 
 
 
328 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  46.82 
 
 
667 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  43.15 
 
 
599 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  46.89 
 
 
323 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 
322 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  43.48 
 
 
315 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  44.26 
 
 
921 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  48.61 
 
 
317 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  46.82 
 
 
291 aa  228  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  44.81 
 
 
914 aa  228  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
541 aa  228  9e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  47 
 
 
308 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  48.21 
 
 
305 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.13 
 
 
907 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  43.42 
 
 
1171 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
321 aa  225  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
307 aa  225  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  43.46 
 
 
930 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  45.02 
 
 
925 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  47.64 
 
 
617 aa  224  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>